金相显微镜是用入射照明来观察金属试样表面(金相组织)的显微镜，它是将光学显微镜技术、光电转换技术、计算机图像处理技术结合在一起而开发研制成的高科技产品，可以在计算机上很方便地观察金相图像，从而对金相图谱进行分析，评级等以及对图片进行输出、打印。
扫描电镜一种新型的电子光学仪器。它具有制样简单、放大倍数可调范围宽、图像的分辨率高、景深大等特点。数十年来，扫描电镜已广泛地应用在生物学、医学、冶金学等学科的领域中，促进了各有关学科的发展。
两种显微镜存在很大的区别，主要有以下几方面：
一、光源不同：金相显微镜采用可见光作为光源，扫描电镜采用电子束作为光源成像。
二、原理不同：金相显微镜利用几何光学成像原理进行成像，扫描电镜利用高能量电子束轰击样品表面，激发出样品表面的各种物理信号，再利用不同的信号探测器接受物理信号转换成图像信息。
三、分辨率：金相显微镜因为光的干涉与衍射作用，分辨率只能局限于0.2-0.5um之间。扫描电镜因为采用电子束作为光源，其分辨率可达到1-3nm之间，因此金相显微镜的组织观察属于微米级分析，扫描电镜的组织观测属于纳米级分析。
四、景深：一般金相显微镜的景深在2-3um之间，因此对样品的表面光滑程度具有*的要求，所以制样过程相对比较复杂。扫描电镜的景深则可高达几个。
