我们在使用新的色谱柱应该在我们自己的液相色谱仪上进行性能测试，即使用色谱柱附带的检验报告上测试条件和样品来测定该色谱柱的柱效。并且，在以后的使用中，应时常对色谱柱进行测试。高效液相色谱柱在使用的过程中常常有堵塞的现象，造成这种现象的主要原因是：
①溶剂中的不溶物
②样品中的不溶物
③泵进样器等中的不溶物
④柱内不溶物的形成等。
如果当色谱柱堵塞以后我们可以对色谱柱进行修复，首先，使用含盐缓冲液后(如离子对试剂)应用溶解性强的溶剂(如水)进行冲洗。其次，先断开检测器，然后用对来自样品中的物质有强溶解性的溶剂进行冲洗，对于反相色谱柱，可使用甲醇、乙睛、四氢呋喃、氯仿、庚烷等，在此条件下，应避免溶剂的pH低于2或高于8。
高效液相色谱柱怎样避免过高的柱压？
虽然高效液相色谱柱能耐受的压力可达6000psi (磅/平方英寸) ,但过高及过大的压力变化均会缩短色谱柱的寿命,避免的方法是：
(1)柱压过高时,尽可能采用较小的流速,以不超过柱最大允许压力的一半为宜。
(2)当流速较大时,应采取流速梯度的办法使流速分步到位。
(3)使用手动进样阀时,进样阀的切换要尽可能的快。否则超过20%的压力冲击会很快使柱报废。当使用多柱联用时,柱切换要避免在高压下进行。
