气相毛细管色谱柱因其高分离能力、高灵敏度、高分析速度等*优点而得到迅速发展。随着弹性石英交联毛细管柱技术的日益成熟和性能的不断完善，已成为分离复杂多组分混合物、及多项目分析的主要手段，在各领域应用中大有取代填充柱的趋势。现在新型气相色谱仪、气相色谱-质谱联用仪基本上都是采用气相毛细管色谱柱进行分离分析。但是，气相毛细管色谱柱柱内径较小，固定液的膜薄，用于食品中残留物分析时，若使用不当，色谱柱性能很快就会下降。
气相毛细管色谱柱优点：
1)可用于浓缩样品。
2)样品不需要溶剂稀释，不存在溶剂的有害影响。
3)可注入较大体积的样品。
4)不会引起色谱柱超载，能有效防止柱污染。
5)分流比调节容易，进样量可大可小。
6)色谱峰窄而尖锐。
7)分析结果重现性好。
8)结构和操作简单，有利于自动化。
气相毛细管色谱柱缺点：
1)不适合浓度和沸点范围宽的混合样品。
2)不适合痕量分析。
3)操作不当会产生分流歧视。
4)由于进样口工作时温度较高或结构限制，对强极性样品会产生吸附、降解或按分子重量重排反应，不适合定量分析。
5)对于挥发性和极性相近的样品，为满足分析重复性和定量精度要求，选取的实验参数多，建立较佳分析方法费时费力。
6)非EPC控制，载气浪费较大。
7)对于数量有限的贵重样品，选用应谨慎。
