荧光显微镜是以紫外线为光源，用以照射被检物体，使之发出荧光，然后在显微镜下观察物体的形状及其所在位置。
荧光显微镜和普通显微镜有以下的区别：
1、照明方式通常为落射式，即光源通过物镜投射于样品上；
2、光源为紫外光，波长较短，分辨力高于普通显微镜；
3、有两个特殊的滤光片，光源前的用以滤除可见光，目镜和物镜之间的用于滤除紫外线，用以保护人眼。
荧光显微镜是免疫荧光细胞化学的基本工具。是由光源、滤板系统和光学系统等主要部件组成。荧光显微镜利用一定波长的光激发标本发射荧光，通过物镜和目镜系统放大以观察标本的荧光图像。细胞中有些物质，如叶绿素等，受紫外线照射后可发荧光；另有一些物质本身虽不能发荧光，但如果用荧光染料或荧光抗体染色后，经紫外线照射亦可发荧光，荧光显微镜就是对这类物质进行定性和定量研究的工具之一。
荧光显微镜使用方法：
(1)先关闭荧光通道，再打开荧光激发器电源，等待15分钟。
(2)等待期间，打开显微镜光源，找到需要观察的样品，选用合适的物镜，调整焦距。
(3)关闭显微镜光源，打开荧光通道。
(4)需要图片，要把镜体上的相应拉杆拉到绿线位子。按下相应附件上的照相按扭。
