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Taqman-LNA探针的合成

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2009/3/16 10:37:33

什么是LNA
    LNA 是新型的核酸类似物,它包含了2'-氧4' 碳亚甲基连接,这个连接限制了呋喃核糖环的灵活性,因而将其结构锁定成一个刚性的双环模式,因此而提高杂交效率和*的稳定性。

LNA 荧光探针优点:

1.增强热稳定性和杂交的特异性
   对实时定量PCR探针提出LNA化学产品增强双链体的热稳定性,同时加强对目标序列杂交的特异性。因此,由非所需激活的荧光背景将大量减少,从而使信号对背景噪音的比例增大。

   LNA 单分子的化学结构决定了其探针与目标序列杂交后的稳定性,与普通的DNA荧光探针相比,其双链在相同的盐溶液中,每增加一个单体LNA分子将导致其熔点提升8°C。强化后的杂交性能可以显著的扩大实验检测的环境限制,同时允许在单试管中进行更复杂的试验。可以通过调整LNA碱基在探针中的位置来调节*熔点(Tm)和杂交的特异性。

2.更易及灵活的探针设计来检测有问题的目标序列

   由于LNA 强化的杂交特征和对熔点温度的影响,含有LNA的实时定量PCR探针,长度较短,可以增加设计的灵活性,同时附和检测设计的指南。因此普通DNA探针某些设计的局限或无法解决的问题都可被减少或消除。
例如, 含大量AT的实时定量PCR探针通常需要30碱基以上(有时超过40碱基)来达到扩增设计的指南,但是可能效果较差。LNA荧光探针的应用可灵活选择LNA的位置,以达到高特异性的设计,短的探针可以很有效的工作,甚至短到13到20个碱基。

3.适用于多种实时定量PCR 系统
   LNA 荧光探针适用于多种实时定量PCR 系统,这基于染料和设备的激发/发射的波长。这为您提供在固定的周期实验环境下自由的选择仪器与试剂系统的组合。这无需额外的资本投入。

 

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