各种不同类型的采样器，都有各自的优点和缺点，有不同的适用场景。在采样过程，要根据病毒采样需求和特点，选用相应的采样器，并遵循相应的使用要求，才能提高采样效能。
(一)样品液浓度
病毒采集液通常通过核酸检测判定环境空气中病毒气溶胶存在及浓度的高低。样品液浓度是检测阳性率高低的重要依据。样品液浓度受采样器采集效率高低、流量大小、采样时间长短、样品液多少四个因素共同决定。通常情况下，采集效率越高、流量越大、采样时间越长、样品液越少，样品液浓度越高。
1、采样器采集效率
采样器采集效率通常用一个参数切割点表示，即该采样器对某粒径的气溶胶采集效率为50%，把这个料径称为该采样器的切割点，粒径大于该切割点的气溶胶，采集效率高于50%。切割点越低，表明该采样器的采集效率越高。采样器的采集效率，与采集器采集方式，采样器设计相关，是采样器的固有特征参数。
采集效率高的采样器有过滤式采样器：FM-15过滤式采样器是一款便携过滤式采样器。可供医疗卫生、食品工业、发酵工业、制药工业和农牧业以及有关研究部门作空气浮游菌及其他颗粒物监测和实验研究的一种新型仪器。本仪器具有适用范围广、小巧便携、操作简单等特点。
2、采样流量
在采样时间相同的情况下，采样器流量大，采集的空气，相应的生物气溶胶量多，采样效能高，检测的阳性率高。采集效率较低的大流量采样器，可以通过大流量补偿，在相同时间内采集到更多的病毒。
流量大的采样器通常有：固体撞击式采样器，离心式采样器。
3、采样时间
采样时间越长，可采集的气溶胶颗粒越多。但采样介质本身的耐受时间，及病毒气溶胶在样品介质上保存时间，又制约着采样时间不能过长，需要根据采样器特点及采样需求科学确定采样时间。
4、样品液量
在采样量相同的情况下，样品液量的多少决定的样品液浓缩，在一定程度上决定检测结果的阳性率。
湿壁气旋式采样器需要的液量多，湿壁气旋式采样器和旋风分离式液体采样器所需要的液量可多可少。
(二)样品液处理
过滤式采样、固体撞击式采样，需要经过处理，才能将样品转化成液体形态进行核酸检测。一是样品的转化难免会有损失，这取决于处理过程样品的转化率，转化率越高，使用效能越高；二是样品处理所需要的液量越多，样品液浓度越低，采样器的使用效能越低；三是样品在处理时，可能存在交叉污染，致使检测结果出现假阳性；四是样品处理过程中，增加了人员的暴露风险，因此，病毒采样尽量减少处理环节。
(三)样品液保存
采集样品通常带回实验室检测，在检测前，需要对样品进行正确保存，避免病毒变性。一是低温保存，从采样地点到实验室，通常使用冷藏箱进行冷藏保存。二是使用病毒保存液保存，病毒保存液可在常温下，一定的时间内确保病毒不变性。
