色谱柱由高压液体泵、检测器及液相色谱柱等三部分组成，其中色谱柱的正确安装和使用，是液相色谱工作的关键;也是色谱工作者获得正确可靠的实验数据的必经之路。
色谱柱安装步骤：
步骤1.检查气体过滤器、载气、进样垫和衬管等检查气体过滤器和进样垫，保证辅助气和检测器的用气畅通有效。如果以前做过较脏样品或活性较高的化合物，需要将进样口的衬管清洗或更换。
步骤2.将螺母和密封垫装在色谱柱上，并将色谱柱两端要小心切平。
步骤3.将色谱柱连接于进样口上色谱柱在进样口中插入深度根据所使用的GC仪器不同而定。正确合适的插入能尽可能地保证试验结果的重现性。通常来说，色谱柱的入口应保持在进样口的中下部，当进样针穿过隔垫*插入进样口后如果针尖与色谱柱入口相差1-2cm，这就是较为理想的状态。
色谱柱的维护只要存在极小的划痕或者聚酰亚胺保护层被破损，熔融石英柱就会断裂。柱箱的连续加热及冷却，柱箱风扇导致的振动，以及缠绕在圆形柱架上都会对柱管施加应力。在这些应力的持续作用下，裂缝将会出现，直到发生断裂。注意：大口径的色谱柱更易于断裂。
避免断裂不要让色谱柱接触尖锐的边角。比如：柱架和标签、gc柱箱的金属边缘、柱切割器实验台上的其他物品，以避免划痕和破损。
避免太紧地缠绕或弯曲色谱柱。恢复若一根断裂的色谱柱的维护已经被加热，很可能就破坏了固定相。丢弃断裂的一段色谱柱，从柱端切割掉6英寸，再进行安装。若断裂的柱子未被加热，采用小体积接头将两段色谱柱连接起来。
