19世纪50年代，法国酒业在欧洲享誉盛名，但啤酒、葡萄酒在酿出后常常会变酸，根本无法饮用。1865年，里尔一家酿酒厂厂主请求巴斯德帮助治治啤酒的病，看看能否加进一种化学药品来阻止啤酒变酸 。
经过长时间的观察，巴斯德发现使酒变酸的“罪魁祸首”是乳酸杆菌。营养丰富的啤酒简直是乳酸杆菌生长的天堂。为了解决这一问题，经过反复多次的试验，他终于发现：只要把酒放在50~60℃的环境里加热半小时，就可以达到既杀死乳酸杆菌又保持口感的效果，这就是著名的“ 巴氏消毒法”，也是“巴氏杀菌法”。
到了1886年，德国农业化学家弗朗茨·冯·索格利特呼吁将巴氏杀菌法应用于向公众出售的牛奶等其他饮品。在巴氏杀菌法诞生后一个多世纪，人们才开始大规模使用它来给牛奶等饮品杀菌。
到了20世纪初，美国和英国规定了牛奶必须经过巴氏杀菌处理。这项诞生于酿酒行业的技术不仅拯救了许多生命，也改变了人们的生活方式，也算是以另一种方式实现了巴斯德治病救人的心愿。
在牛奶生产过程中使用的巴氏杀菌法与酿酒厂使用的巴氏杀菌法略有不同，它经过调整后专门针对牛奶中的有害菌，换句话说，巴氏杀菌法并不会杀死牛奶中的全部细菌，这也是为什么经过巴氏杀菌的牛奶保质期较短，在放置一段时间后仍旧会变质。不过大家也不用担心，这些”留下来“的细菌基本对人体无害甚至是有益的，我们*可以放心饮用。
现如今，巴氏杀菌法已被广泛应用在乳品行业。许多新型全产业链羊乳企业，先进的工艺与设备结合。在前处理车间，经检验人员对鲜奶进行检测后，进行巴氏杀菌以及均质净乳，去除鲜奶中的各种杂质和有害病菌，最大限度的保留鲜奶内的活性物质，实现微生物的较小化，营养物质的较大化。
