在线硅酸根分析仪的工作原理是基于朗伯—比耳定律，应用硅钼蓝光电比色法进行分析
在线硅酸根分析仪有6个测量通道:4个水样通道，1个标准液通道和1个空白水通道。具体测量过程如下:
1）水样被送入一个恒位器。通道调节阀都可以调节水样流量，水样必须总是保持溢流排放;根据提前设置好的程序，通道选择阀选中一路水样通道，选定的水样被蠕动泵送入恒温反应槽;反应槽内水样被预热到45℃，排除了水样温度对测量的影响;把钼酸和硫酸加人涡流搅拌器，(加入钼酸铵生成硅钼黄、磷钼黄，再加入硫酸降低样水的pH值，将pH值控制1.2至1.3之间)，再加入草酸，掩蔽掉磷钼黄;再加入硫酸亚铁铵，将水样中的硅钼黄还原成蓝色的硅钼蓝。
2）有色的水样流进恒温的光度计并*充满。光度计顶端的通气孔保证光度计中不存在气泡。
3）将含有硅钼蓝的水样送入光度计进行光电比色测量，此时用波长为815nm的光照射水样，硅酸的浓度通过标准曲线计算。当光度计中的水样水位过高时，将会被虹吸管自动排出。
