在了解水产品检测方法之前，首先要了解的是涉及水产品检测项目都有哪些，国抽细则中规定的水产品检测项目包括：重金属(铅、镉、铬、汞、锡等)、孔雀石绿、氯霉素、硝基呋喃类：呋喃唑酮(AOZ)、呋喃它酮( AMOZ )、呋喃妥因(AHD)、呋喃西林(SEM)、呋喃那斯、磺胺类、激素类、四环素类、金霉素、土霉素、甲砜霉素、氟苯尼考、喹诺酮类药物：噁喹酸、诺氟沙星、恩诺沙星、环丙沙星、氧氟沙星。
一、高效液相色谱
高效液相色谱法是在经典色谱法的基础上，引用了气相色谱的理论，在技术上，流动相改为高压输送(最高输送压力可达4.9107Pa);色谱柱是以特殊的方法用小粒径的填料填充而成，从而使柱效大大高于经典液相色谱(每米塔板数可达几万或几十万);同时柱后连有高灵敏度的检测器，可对流出物进行连续检测。
二、高效液相色谱-串联质谱法
高效液相色谱是一种准确度高，分离范围广的快速分离方法，它对化合物的结构破坏性小，适合有机分子和生物分子的分离。质谱具有其他分析方法的灵敏度，对于未知化合物的结构分析定性十分准确，对相应的标准样品要求也比较低。质谱可以和气相联用如GC/MS,也可以和高效液相色谱联用如HPLC/MS。由于色谱和质谱灵敏度相当，再加上分离效果很好的色谱可以作为质谱的进样系统，质谱作为色谱的鉴定仪速度快，分离好，应用广。色谱-质谱联用成为好的用于分析微量有机混合物的仪器。
三、其他联用
各种分析方法联用是现代兽药残留分析乃至整个分析化学方法上的发展特点，计算机的应用加速了这个趋势。联用技术可扬长避短，一般集分离、定量和定性(分子结构信息)于一体，因而特别适用于确证性分析。常见的联用有GC-质谱(MS)、LC(色谱)-MS等。质谱无疑可作为色谱技术的通用型检测器。使用微型柱和适宜的接口技术，如热喷雾(TSP)、微粒束(PB)等解决了色谱与MS难以连接的问题;使用软电离方法，如快原子轰击(FAB)、场解吸(FD)等解决了难气化物质的离子化问题;联用结合了色谱快速高效分离和MS等快速定性的优点，提高了兽药残留的检测速度和拓宽了检测的范围。3微生物检测法很早就被用于检测抗菌药物的残留测定，如纸片法(PD)、拭子法(STOP)等。采用传统的微生物检测方法，缺点是时间长，显色状态判断通过肉眼辨别，易产生误差，对微红色者无法做出准确判断，操作复杂。可作为1种筛选方法对大批样品同时检测。
四、免疫层析法
进入20世纪90年代免疫检测方法得到了飞速发展，推动了药物残留检测发展的进程，一系列免疫检测试剂盒的生产与应用加快了残留分析的标准化。目前，兽药快速检测ELISA试剂盒已大量生产和销售，广泛用于动物性产品中兽药残留的检测。国内已经有几家实验室开始研制试剂盒，其中一些试剂盒检测限、回收率、重复性、再现性、特异性等主要技术指标均达到国外试剂盒水平，部分指标高于国外试剂盒水平，满足残留快速检测要求，适合用于我国动物性食品兽药残留的快速筛选。目前，市场上出现的ELISA试纸条检测法，操作比试剂盒简单，提高了检测速度和降低了检测费用，能进行现场、实时监测，但可靠性较差，普遍出现假阳性和漏检的情况。
五、生物传感器技术
近30年来发展起来的新型、高效的分析方法。所谓生物传感器即由生物活性物质作为敏感元件，即生物识别系统(感受器),再配上适当的换能器及输出显示装置所构成的分析工具。其原理为分子识别部分与被识别物质相接触，可发生化学变化、热变化、光变化以及直接诱导电信号，而后利用电学测量方法进行检测和控制及显示输出。生物传感器的种类包括离子选择电极传感器、气敏电极传感器、酶免疫传感器、压电晶体传感器等，可测定离子、气体、底物、酶、抗生素、维生素等物质。
