气相色谱质谱联用仪是一种精密设备，可用于测定多种成分，比如脂溶性挥发性成分、农残等。一般由质谱同气相色谱仪联用，快速获取复杂样品中各组份的定性定量信息，提升分析效率，实现快速GC/MS分析。
那么，GC/MS分析技术有哪些优缺点呢？
优点：
一般应用可省略色谱检测器：GC作为进样系统，将待测样品分离后直接导入质谱进行检测，既满足了质谱分析对样品单一性的要求，又省去样品制备、转移的繁琐过程，不仅避免了样品受污染，对质谱进样量还能有效控制，也减少了质谱仪的污染，极大地提高了对混合物分离、定性定量效率。
定性能力高：用色谱保留时间结合化合物的指纹质谱图鉴定组分，大大优于仅靠色谱保留时间。GC-MS的定性指标有分子离子、功能团离子、离子峰强度比、同位素离子峰、离子反应的母子离子质量数以及总离子流色谱峰、选择离子色谱峰和选择反应色谱峰所对应的保留时间窗。
可分离尚未分离的色谱峰：用提取离子、选择离子监测或选择反应监测法，以及结合某些数据处理方法(如AMDIS)，可分离总离子流色谱图上尚未分离或被化学噪声掩盖的色谱峰。
可提高定量分析精度：通过用同位素稀释和内标技术可提高定量精度和定性能力。
提高仪器功能，实现分析自动化：计算机的多功能使仪器的结构更简单，操作更方便，更易于实现分析工作的自动化。
不足：
分析对象有限制：分析对象限于在300℃左右及以下可以汽化、并且能离子化的样品；在加热过程中易分解的、极性太强的化合物，如有机酸类等，则需进行酯化衍生处理才可进行GC—MS分析，如果样品不能汽化也不能酯化则需采取LC—MS或其他方法分析；
测试条件有限制：GC—MS分析样品应是有机溶液，固体或水溶液中的有机物一般不能测定，需进行萃取分离变为有机溶液，或采用热裂解、顶空进样技术。
质谱应用有限制：目前质谱还有一个很重要的不足是对很多异构体(尤其是位置异构)无法分辨。
