成像流式细胞仪是将待测细胞或微粒进行荧光染色后制成悬液标本,在一定气体压力下将待测样品压入流动室,用不含细胞或微粒的缓冲液(又称鞘液)在高压下从鞘液管喷出,鞘液管入口方向与待测细胞或微粒流成一定角度,使鞘液包绕着细胞或微粒高速流动,形成一个圆形的流束(即鞘流),待测细胞在鞘液的包裹下单行排列,依次通过流式细胞仪的检测区域,经激发光激发后产生荧光信号。
成像流式细胞仪工作过程：
开始使用流式细胞仪，第一步是准备要分析的样品。从细胞培养物，血液或分解的组织中获得的细胞应制成悬浮液。将该细胞悬浮液分成数个试管进行染色，保留未染色细胞作为对照。通过添加标记有荧光探针的抗体或染色细胞成分的染料对其他细胞样品染色。分析细胞内蛋白质时，首先必须将细胞固定（使用福尔马林缓冲液）并进行透化（使用透化剂），以使抗体和染料进入细胞。细胞与抗体或染料孵育后，将细胞在缓冲液中洗涤，然后重悬在基于盐的缓冲液中进行分析。然后将准备好的样品引入流式细胞仪。
成像流式细胞仪有三个主要组成部分：液流系统，光学系统和电子系统。在流式细胞仪的中心部分，流通池中样品材料遇到激发光并散射光，随后该光被检测系统读取和记录。既具备流式细胞术的速度、灵敏度和分型能力，也具备显微镜的清晰图像和有效洞察力功能。
