关于荧光显微镜相机芯片的选择，CCD芯片在荧光显微镜市场中一直是一项成熟的技术，适用于高质量的显微镜相机，但是CMOS芯片发展迅速，“背照式结构”(BSI)的技术进入科学领域，图像芯片领域日渐成熟，更具竞争力。该技术反转了像素结构，将光敏光电二极管直接置于微透镜下，从而显著提高像素的量子效率。
CMOS芯片提供极低噪声，高帧率，宽动态范围，高量子效率和高分辨率的能力，在要求出色的成像应用中获得广泛认可。在噪声水平方面，CMOS芯片能与传统的CCD芯片相媲美，甚至表现比CCD更出色，帧速率、分辨率以及满足更低的功耗/散热要求的逐渐成熟优化，对于一般的荧光成像，CMOS芯片是科学领域研究获得出色图像的理想选择。
广州明慧显微镜相机MHD系列、MHS系列产品大部分采用Sony Exmor CMOS背照式传感器的C接口CMOS USB3.0相机，是新一代科学CMOS相机，MHC系列采用索尼ExView HAD CCD芯片传感器，传感器接收弥散光，大幅降低传感器的噪声，在黑暗的环境下也可得到高亮度的照片。用于弱光或荧光图像的拍摄与分析，用于病理分析等对色彩要求高的领域。
当然，影响显微镜成像的变量有很多，不止芯片的选择，一些成像变量也影响着图像质量。为了最大限度提高图像质量，我们应将适当的相机技术与显微镜系统相结合，例如使用光照均匀的光源、高NA物镜，滤光片组合等，确保获得出色的图像。
