一、分析效率
主要关注以下参数：每秒可实现多大通道(多少驻留时间、多少延迟时间)、MRM测定正负极性切换时间、扫描测定速度等。各个参数的优化选择可以大大提高用户的分析测定效率。
二、稳定性
关注离子化接口是否稳定，是否可以在长时间持续或间断测定序列中获得稳定且可靠的数据，碰撞室串扰zui小化保证高定量精度，准确捕捉超快速分析中的尖锐色谱峰，重现性是否良好。
三、日常维护
在日常工作中，对于仪器的维护不可少，从用户角度考虑，日常维护是否简单便捷将会是考虑的重要因素之一，若是太过复杂繁琐无疑将会给用户带来额外的负担。因此如果厂家还能提供定期的上门维护服务将会有很大裨益。
四、操作性
主要针对质谱工作站软件。一套好的软件操作平台与仪器本身的设计有很大的关系，采购者可以根据自己的需要来操作检验质谱工作站：一般要求软件对分析数据具有可靠的安全性，简单实用可操作性强，能够自动编辑分析方法(具有推荐方法)，自动进行数据的采集、处理、分析，自动进行条件优化选择(很重要)、自动显示对分析过程各参数的实时监控、自动报警出现的错误并提示原因、自动进行QA/QC控制。在实际操作过程中还需关注软件的流畅性，有些仪器所配置的内存较小，在长时间的使用后经常会出现软件卡顿甚至死机的情况出现，造成不必要的麻烦。
对于二手液质联用仪的指标，验收，有几个是比较重要的建议：
(1)灵敏度，要在单位质量分辨率下
(2)分辨率，要指明在哪个具体的质量处
(3)单位质量分辨下的m/z范围
