毛细管电泳实际上包含电泳、色谱及其交叉内容，它使分析化学得以从微升水平进入纳升水平，并使单细胞分析，乃至单分子分析成为可能。双电层是指两相之间的分离表面由相对固定和游离的两部分离子组成的与表面异号的离子层，凡是浸没在液体中的界面都会产生双电层。在毛细管电泳中，无论是带电粒子的表面还是毛细管管壁的表面都有双电层。
毛细管电泳故障解决
1 断流的可能原因
a、有气泡。解决办法：所有进入毛细管的液体都要超声排气，特别是容易起气泡的溶液，如SDS。
b、有沉淀物。解决办法：所有进入毛细管的液体都要过滤，滤膜孔径要比毛细管内径小。
c、毛细管有裂口，最容易裂的地方是窗口处和毛细管出口端，有时候看不出来，因为加压注水的时候仍能看到液滴出来，需要用手碰一碰才能发现。
2 基线漂移
a、毛细管没活化好：需要用0.1 M氢氧化钠多冲一冲
b、毛细管没平衡好：冲完氢氧化钠和水后需要用buffer再冲一段时间，这个时间得根据buffer的组成而定。必要时候需要跑空白一段时间。
c、灯接近寿命：查看灯的使用时间，如果已经两千多个小时接近三千小时的话，可以考虑换灯了。
d、毛细管寿命已到。毛细管是有使用寿命的，这个寿命长短说不好，得看你怎么保养，当然，还跟使用的buffer有关。有些buffer特别伤管子的。
3 常见缓冲溶液的使用
缓冲溶液一般是先配好stock solution，使用的时候再进行稀释。但是stock solution也不能长时间存放，0.1 M 的磷酸、硼砂等溶液常温下一个星期就会有变化，再长时间可以看到有沉淀析出。但是也不能因此放到冰箱去，因为放到冰箱也会有沉淀析出，最好常温存放，然后每星期重配一次。另外，配置硼砂的时候要稍微加热帮助溶解，不然溶解不了。但加热也不要太猛烈，不然溶解效果也是不好。
4 sds使用注意事项
sds在配置过程中容易产生气泡，所以如果用容量瓶来配置是不实际的。这时候就不能对sds的浓度做精确要求。所以，一般用量筒或者离心管配置就好了，加水的时候用玻棒引流，小心的搅拌，边配置边超声促进溶解。
5 毛细管的使用和维护
避免用强碱溶液长时间冲洗，比如1 M氢氧化钠，内壁会被腐蚀的。长时间不用的时候应该吹干，两端密封保存。也有人建议用水封存。
6 UV灯的使用注意事项
不要暴力关电，要在操作界面按关灯键。一般不超过两小时暂停检测不需要关灯，因为开关灯都是会对灯造成损害的。
