使用制药均质机需要注意以下问题：
先接通电源，电源相符，并注意地线可靠接地，打开总电源开关，电源指示灯亮。电机接线后或长期不用重新起用时都应点动试转，乳化缸转向为从上往下看为逆转。调试时应先点动搅拌试转，确认无误时再让均质器运转。正确接通均质锅各管道(包括各溢水口、放水口和排污口等)。
其次，制药均质机抽真空工作前一定要检查锅是否与锅盖平贴，锅口、料口盖等是否盖严，密封可靠。关闭锅盖上各阀接口，然后打开锅盖上的真空阀门，再开启真空泵抽真空，达到要求后关闭真空泵，同时关真空阀门。
均质切削、刮板搅拌：加料后(制药均质机调试时，可用水代替)再分别打开对应的控制开关控制均质器的运转以及刮板搅拌的运转。乳化启动前也应点动，检查搅拌刮壁是否有异常，如有应即刻排除。
然后真空泵在均质锅密封状况下方可启动运转。如有特殊需要敞通大气启动泵，运转不能过3分钟。真空泵严禁无工作液运转。泵运行时严禁堵塞排气口。定期检查制药均质机各部件及轴承内的润滑油及油脂，及时更换干净的润滑油及油脂。
保持设备的清洁。每次要停止使用或更换物料时都应清洗均质器的与工作液接触部分，特别是其头部的切割轮切割套、均质轴套内的滑动轴承及轴套。清洗重新组装后手转叶轮应无卡滞现象，锅体与锅盖两法兰相对固定后点动均质器电机转向正确，无其他异常，方可启动运转。
