生物安全柜是为操作原代培养物、菌毒株以及诊断性标本等具有感染性的实验材料时，用来保护操作者本人、实验室环境以及实验材料，使其避免暴露于上述操作过程中可能产生的感染性气溶胶和溅出物而设计。
购买生物安全柜时应考虑所提供的生物防护作用是针对操作人员个人的还是针对实验样品的；若是针对操作人员的防护应明确是针对病原微生物的还是针对有毒化学物质或两者兼而有之。若是针对病原微生物的还应强调微生物的生物危害级别；
1.安放
进入生物安全柜的空气速率约是0.45 m/s，按照这种速率，气流的完整性很容易受附近人员的走动、窗户的开关、门的开启和关闭、空调运行等因素的影响。为避免上述因素的干扰，生物安全柜应放在远离人员活动、物品流动以及可能会扰乱气流的地方。为了方便起见，应在安全柜的后面、左右两侧面各留30 cm的空间，以利于安全柜的维护。上端应留30～35 cnl空间，以便准确测量空气通过排风过滤器的速度及排风过滤器的更换。
2.操作人员
使用生物安全柜时，操作人员手臂的伸入或取出时应缓慢，垂直于前端开口处，从而保证安全柜前端气流的完整性。应在手或胳膊伸入柜中1 min后开始操作，以便安全柜对手或胳膊表面的空气进行净化处理。实验所需器材应一次性放人生物安全柜，尽量减少或限制操作人员手在安全柜中的进出次数。
3.实验材料的放置
Ⅱ级生物安全柜前端开口处严禁被纸张、设备或其他物品覆盖。物品放人生物安全柜后，表面要用70%的乙醇擦拭。柜内应备有1块浸过消毒剂的毛巾，以便蘸吸溅出的液体。实验材料尽量放在柜的后面，笨重的物品放在一边，产生气溶胶的物品也应放在柜的后面。实验器材应按顺序从清洁的排放到污染的。污染的实验材料不。应随时拿出柜外，操作者的手也不应频繁地进出安全柜。
4.操作和维持
大多数的生物安全柜设计成一天24 h开机，调查发现连续开机有利于控制实验室灰尘和粒子。Ⅱ级A型不用时可以关闭。Ⅱ级B型在使用时要保持实验室空气平衡，因此一天中若有数个操作过程，其间不应中断运行。实验开始前5 rain就应启动生物安全柜，净化局部空气。使用中若出现任何故障均应及时向上级人员报告并请专职技术人员维修。
5.紫外线
生物安全柜中不需要紫外灯。假女盯要用，每周应对灯管作清洁，除去尘埃，保证杀菌效果。应定期监测紫外灯的辐射强度。要防止紫外线对眼睛或皮肤的灼伤。
6.明火
生物安全柜内近似无菌的环境中应避免使用明火，一方面它可干扰气流运行，其次，若操作中使用挥发性或易燃物质时会造成危险。操作时需用接种环的，尽可能地用一次性的塑料接种环，使用金属接种环的应该用微型燃烧器或电炉灭菌而不应该使用明火。
7.溢出
在实验室工作的每一个人都应熟知含微生物的样品溢出时的处理程序。一旦生物安全柜中发生有生物危害的物品溢出时，应在安全柜处于工作状态下立即进行清理。要使用有效的消毒剂，并在处理过程中尽可能减少气溶胶生成。实验完毕后，柜中所有接触病原体的材料均应作消毒灭菌处理。
8.清洁和消毒
工作完毕后，柜中所有的物品都应清除表面污染并移出柜外，柜内工作台表面和柜的内壁应用含氯石灰(漂白粉)或70%乙醇消毒。若用腐蚀性的化学剂消毒后还应用灭菌水再擦洗。关机前应运行5 min，以便对残留气体进行净化。
9.清除污染
滤膜更换之前生物安全柜要由专业人员用甲醛熏蒸消毒。
10.个人防护设施
使用生物安全柜的操作人员应穿工作服。在生物安全1～2级实验室中工作的人员可穿普通的工作服；在3～4级实验室工作的人穿反背式实验隔离衣具有更好的保护效果。手套应能包住腕关节上的防护服。有些操作可能要戴口罩和眼罩。
11.警报
生物安全柜有发出1种或2种警报的功能。一当窗框移动时，警报会响，表明操作者将窗框移到一个不合适的地方去了，纠正以后警报解除。气流警报表明柜中正常气流运行模式中断，对操作者的保护作用和对样品防污染的作用减至至低，存在危险。警报响时，应立即停止工作并迅速报告上级人员。作为制造商，在产品的使用说明书的操作部分应详细论述这一内容，对有关人员使用生物安全柜的培训材料中也应有此内容。
12.生物安全柜的认证
每台生物安全柜功能的完整性和操作的有效性能都应作检定。安装时应按国家或国际标准检定，以后应根据制造商说明书定期由专职技术人员检定。对生物安全柜使用有效性的评价应包括以下内容：功能完整性实验，HEPA滤器密封性试验，对向下气流速度、正面气流速度、负压/换气次数、气流的烟幕模式，以及警报和互锁系统进行测试。还可选择漏电、光照度、紫外光辐射强度，噪音级别，振动性等试验。检测人员要经过专门的培训，采用专门的技术和仪器设备。建议由有资质的专业人员来进行测试。
