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玉米考种系统主要应用在农业领域的田间作物测产及考种等，通过摄像头拍摄照片，软件自动计算种子数量，种子的面积、周长、长度、宽度、长宽比等数据，根据天平所得的重量与种子的数量自动计算出千粒重，不仅如此，该仪器还具有独立的数据管理系统，对处理之后的数据可进行统一管理，并能实现数据查看，图片管理，数据查询以及数据导出等功能，在快速采集玉米穗部考种数据的同时保存果穗图像以备追溯。

实质上，室内考种就是室内选择，其主要任务是进一步考察作物的特征特性，以弥补田间观察选择之不足。在传统的种子育种中，考种工作人员需要使用尺子来测量玉米的穗长、穗粗、轴粗、种粒的长宽度，粒高，还需要肉眼数行粒数观看玉米的胚芽等，在这过程中需要花费很长的时间并且步骤繁琐，而且工作人员长时间的观看非常容易因为视觉疲劳而出现错误。因此针对这些缺陷，玉米考种系统的研发和应用，很好的满足室内考种的需要。

现代农业的发展离不开农业育种工作，考种系统在现代农业育种中的应用为考种工作提供了很大的便利，大幅度的减轻工作人员的负担，节省大量的时间以及人力物力，同时也推动农业育种的发展。