不同的肥液处理方法都不同，如，废酸液需先用耐酸塑料网纱或玻璃纤维过滤，然后加碱中和，调PH值至6-8后可排出，少量废渣埋于地下。有机溶剂回收于有机污桶内，采用蒸馏、精馏等分离办法回收。实验室内大量使用冷凝用水，无污染可直接排放。重金属离子（包括）沉淀法等集中处理。
处理废液注意事项
1、需要先将废液分别进行处理，如果废液是在贮存后一并进行处理时，虽然这时的处理方法会有所区别，但在原则上要将可以统一处理的各种化合物收集后进行处理，这样可以节约处理时的成本；
2、在处理时废液的组成可能会有所不同，所以在处理的过程中，往往会伴随着有毒气体以及发热，爆炸等危险的情况发生，所以，当废液在处理之前必须充分了解废液的性质，然后分别加入少量处理溶液所需要添加的药品，必须边观察边进行操作；
3、当废液中.含有过氧化物，C3H5O9N3之类爆炸性物质，需要进行谨慎的操作，并应尽快的进行处理；
4、实验室废液在处理含有放射性物质的废弃物，需要使用另外的方法进行收集，在处理时必须严格按照有关的规定，严防废液的泄漏，谨慎的进行处理。
