显微光谱系统创造性地将激发光、荧光和滤光片集成在一个探头之中。同时，配合微区探头耦合模块，能将荧光光谱测量的空间分辨率提高至 1μm。显微光谱系统，顾名思义即显微镜系统与光谱仪系统联用，既有显微镜成像的功能，又有光谱分析的功能。该系统可以实现微米级样品的荧光光谱、反射光谱、透射光谱、拉曼光谱等光谱分析，普遍应用于材料领域、生物技术、矿物分析、微纳光学等领域。
结构组成：
显微光谱系统可分为三个模块：照明模块、光谱接收模块以及成像模块。
1、照明模块
显微光谱系统的照明模块一般分为科勒照明和共焦照明两种。
a)科勒照明的光源一般为显微镜自带的卤素灯，通过透镜组将卤素灯丝成像于物镜的后焦平面上，如此，物体可获得较为明亮且均匀的全场照明；
b)共焦照明是将照明光源(例如激光、氙灯等)通过光纤引入显微光谱系统，光纤输出端面经过光学系统成像于物体面上，即入射端面与物体面共轭，实现定点照明或激发。
2、光谱接收模块
该模块由光纤以及微型光谱仪组成，其中光纤接收光路为共焦接收，即接收面和物体面为共轭面，实现定点光谱接收。接收光纤一端接入显微镜光路，另一端连接至微型光谱仪，从而获取物体微观区域内的光谱信息。
3、成像模块
该模块为CCD相机，在显微镜的基础上，将CCD/CMOS相机放置在物体面的共轭面上，在测量光谱的同时，可以实现物体图像实时采集，即共轭成像。
