自上世纪以来，由于经济增长和人类活动的影响，越来越多的地表水源逐渐从贫营养、中营养向富营养化状态转化。伴随水体营养化而来的便是藻类的繁殖，尤其在气温较高的5-10月份，藻类的大量生长直接影响自来水厂的净水工艺及水质安全。那么，在藻类繁殖的季节，水源水水质都会发生什么变化呢？
1.pH异常波动
自然水体中存在着CO2/H2CO3/HCO3-/CO32-之间的碳酸平衡，当在白天光照较强时，含有叶绿体的藻类就会进行光合作用，吸收水体中的CO2转化成O2及OH-，使水中pH值上升(2)，藻类聚集多时，甚至导致pH超标。当光照强度下降时，水体中生物的呼吸作用整体大于光合作用时，生物消耗水中的O2，产生CO2，溶于水后产生H2CO3，导致水体中pH下降。
2.溶解氧下降
当藻类大量繁殖时，由于水面被藻类覆盖，导致水体中下层缺氧，造成大量动植物死亡。微生物分解动植物尸体时需消耗大量氧气，导致水体溶解氧急剧下降，并可能引起水体发臭、发黑。
3.氨氮升高
藻类正常生长时，氨氮可作为营养成分被藻类吸收，并转化成有机物。当藻类大量繁殖，导致生物大量死亡时，微生物分解动植物尸体会产生大量氨氮。另外，藻类细胞自溶与有机碎屑沉积物的矿化作用，使以颗粒状结合的有机氮以氨氮的形式释放到水体中，从而使氨氮升高。
4.高锰酸盐指数升高
藻类是水体中重要的有机物制造者，正常藻类的代谢会向水体中释放有机物。另外，藻类在死亡分解、沉积过程中也将产生大量的有机物，并因消耗水中大量的溶解氧，使水体形成还原性环境，从而使高锰酸盐指数增加。
5.产生异味异色
藻类在繁殖生长过程中分泌出的化学物质，会使水质出现异味，如硅藻会产生土腥味、鱼腥味；绿藻产生鱼腥味、草腥味、沼泽味；蓝藻产生鱼腥味、腐败味以及粪臭味。部分藻类在死亡腐烂后还会导致大片水域出现腥臭气味，当藻类数量聚集较多时，水体很难自我净化，易产生异味。
色是藻类的次生物，大多数的藻类都有颜色，其正常的新陈代谢，也会导致水体产生异色，如蓝绿色、黄褐色、红棕色等。
6.产生毒素
部分藻类在生长过程中，会产生一定的有毒物质，如蓝藻的代谢会产生肝毒素和神经毒素，一般水处理工艺很难去除，对生物和人体健康造成很大的影响。湖泊、水库等地表水源藻类的治理是一项复杂的工程，涉及环保、水利、农业等多个领域。作为湖泊、水库等水资源的使用方，自来水厂更多地是从制水工艺中进行调整，以避免藻类的繁殖影响到供水安全。
在藻类大量繁殖的季节，自来水厂在做好除藻工作(如混凝前投加消毒剂，增大混凝剂用量等)的同时，也需密切监测因藻类繁殖导致的工艺控制核心指标的变化，如影响混凝剂水解的pH值，影响矾花紧实程度的溶解氧以及影响消毒效果的氨氮等指标，根据监测结果及时调整制水工艺，保证供水安全。
