所谓“工欲善其事，必先利其器”任何一项工事都离不开得力工具，就以贴近我们生活的科研项目来讲，研究人员除了要具备专业丰厚的知识外，还得拥有理想的研究工具，例如显微镜。然而显微镜的概念太过笼统，按照研究领域以及应用场景的不同我们可以将显微镜分为多种类别。
按照结构来看的话，我们可以将显微镜分为正置显微镜、倒置显微镜以及体视显微镜；而按照应用领域来看我们可以分为生物显微镜以及工业显微镜；按照档次来分的话可以分为教学级显微镜以及科研级显微镜。
正置显微镜一般是指显微镜的物镜在载物台的上方，光源在显微镜的载物台下方，多以观察细胞结构以及动植物切片为主，倒置显微镜则正好相反，光源在上方，物镜在下方，它可以观察的样品尺寸相对较大，比如大尺寸以及培养皿中的细胞分析观察应用较多。
生物显微镜多用于生命科学领域中，工业显微镜多用于工业应用中，其实很好理解，生命科学领域多指的是细胞等的研究，其中生物显微镜也可分为正置生物显微镜以及倒置生物显微镜，工业显微镜也一样，通常的倒置工业显微镜多用于大样品大材料的分析研究。
当然还有一种比较特殊显微镜，那就是体视显微镜，体视显微镜的放大倍数一般在几倍到一百倍左右，工作距离长，多用于样品的整体结构观察分析，也可用于解剖领域中。
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