实验室超纯水器通常由原水预处理系统、反渗透纯化系统、超纯化后处理系统三部分组成。预处理的目的主要是使原水达到反渗透膜分离组件的进水要求，保证反渗透纯化系统的稳定运行。 运行
当设备运行到一段时间之后，会出现设备发热的情况，这种情况属于正常的，但当设备运行一段时间后，需要让设备暂时休息一会。
再次，使用超纯水机的工作时间每天维持在八小时，十小时也是可以的，不过运行时间每天8小时为佳。然后，在使用一段时间后，用户要对设备进行清洗，使受到污染的设备恢复原有的性能。而在恢复设备性能的同时，还要尽量保证清洗的安全，不伤害到超纯水机。
定期清洗
对于超纯水器的日常运行中，超纯水机需要定期反洗，反洗时进行压缩空气气体摩擦，反洗合格后静置10分钟左右再正洗。正洗出水合格后方可投入使用，不要将空气带入反渗透，此外，还要定期检查、及时更换精密过滤器滤，防止滤芯因安装或质量问题发生泄露所引起的反渗透膜的颗粒污染。
一般情况下是每月检查一次，2～3个月更换一次滤芯。运行时还应经常检查精密过滤器内是否有气体，不能让空气带入反渗透膜。对备用或长期停运的精密过滤器，要采取保护的方法防止细菌大量繁殖。
