蛋白质变性剂是一类能使蛋白质发生变性作用的试剂。蛋白质变性是指当蛋白质受物理或化学因素的影响，其分子内部原有的结构和性质发生改变的过程。一般认为蛋白质的二级结构和三级结构有了改变或遭到破坏，都是变性的结果。
常见的蛋白质变性剂有强酸、强碱、重金属盐、丙酮、尿素、盐酸胍和异硫氰酸胍等。在生化实验中，常需要对蛋白质进行变性研究，一般我们常用尿素、盐酸胍和异硫氰酸胍这三种蛋白质变性剂。今天我们就来讲讲这三种蛋白质变性剂的优缺点、区别、变性机制和注意事项等内容。
尿素、盐酸胍和异硫氰酸胍的优缺点：
尿素的溶解能力和变性能力相对较弱，但具有不电离、呈中性、成本低、蛋白质复性后不会造成大量蛋白质沉淀等优点。
盐酸胍的溶解能力和变性能力相对较强，但成本比尿素高、在酸性条件下易产生沉淀、可能对蛋白质离子交换色谱有干扰等缺点。
异硫氰酸胍的溶解能力和变性能力是这三种蛋白质变性剂中强的，同时也是最贵的。
尿素、盐酸胍和异硫氰酸胍的区别：
浓度：在室温下，4~6mol/L尿素和3~4mol/L盐酸胍，可使球状蛋白质从天然状态转变至变性状态的中点，通常增加变性剂浓度可提高变性程度，一般来说8mol/L尿素和6mol/L盐酸胍可以使蛋白质转变为变性状态。不过也有一些球状蛋白质，甚至在8mol/L尿素和6mol/L盐酸胍溶液中也不能变性，然而继续提高溶液浓度，在8mol/L盐酸胍溶液中，蛋白质一般以无规则卷曲（变性）构象状态存在。
溶解度：尿素溶解能力较盐酸胍慢而弱，盐酸胍溶解能力较异硫氰酸胍慢而弱。尿素的溶解度为70%~90%，它在作用时间较长或温度较高时会裂解形成氰酸盐，对重组蛋白质的氨基进行共价修饰；盐酸胍溶解能力达95%以上，且溶解作用快而不造成重组蛋白质的共价修饰。
