磁力搅拌器利用了磁场和漩涡的原理，将沉入搅拌子的待搅拌液体之容器放于磁力搅拌器的底座上，当磁力搅拌器通电，底座附近产生一个旋转的磁场带动搅拌子成圆周循环运动，进而容器液体内形成一个漩涡，从而达到搅拌液体的目的。
目前实验室中使用的搅拌器主要是两种：电动搅拌器与磁力搅拌器，其中，磁力搅拌器适用于粘稠度不大的液体或者固液混合物。
磁力搅拌子为磁力搅拌器专用配件，常用的外形分三种A、B、C型，A型又为橄榄型，它专门用于圆底型瓶子搅拌。B型和C型用途基本相似。这三款搅拌子外型尺寸都有大有小，所以购买时还应根据容量瓶底大小来选购。
其次还要根据溶液的量、粘度和容器的形状择合适的转子。有些很小的转子可以在小的平底瓶里面搅拌几毫升溶液，大的转子可以搅拌体积较大的溶液；溶液粘度较大需要用较大的转子，有时粘度太大用磁力搅拌无法搅拌均匀时可以考虑用机械搅拌；有些转子类似柠檬的形状，可以用在圆底烧瓶中，直型的可以用在平底容器中。
最后，高温条件对搅拌子的影响。我们目前常用的搅拌子在高温条件下会逐渐退磁，所以使用一段时间后要确认其是否还有足够的磁性。另外有时转子除了自传以外还会发生公转，主要与玻璃器皿的光滑度，转子与器皿接触的面积等有关。
