全自动菌落计数仪是微生物实验中普遍的实验之一，是统计物品含菌数的有效方法，广泛用于食品、饮料、药品、生物制品、化妆品、卫生用品、饮用水、生活污水、工业废水、临床标本中细菌数的检验。常见测量方法：
1.计数器测量方法
打算用血细胞计数器计数。取一定体积的样品细胞悬液放在血细胞计数器的计数室中，用显微镜观察和计数。由于计数室的体积是固定的（o.1mm3），因此样品中细菌的数量可以根据计数器规模中的细菌数量进行计算，该方法简便易行，可马上得到结果（该方法不仅适用于细菌计数，还适用于细菌计数。计数酵母和霉菌孢子）。
2.电子计数器计数法
电子计数器的工作原理是测量小孔中液体的电阻变化。小孔只能穿越一个单元格。当细胞通过小孔时，电阻显着增加，形成脉冲并自动纪录在电子记录装置上。此方法的测量结果相对较好，但只能识别微粒的尺寸，无法识别区分是不是是细菌。因此，细菌悬浮液中不需要碎片。
3.活细胞计数法
通常使用平板菌落计数法，其设计规范是每种活细菌都能发育一个菌落，取一定量的细菌悬液，进行一系列的稀释，然后将定量的稀释液铺板。根据培养菌落的数量可以计算出培养物中的活菌数，该方法灵敏度高，是检测活菌数水污染的一种方法，也是世界上许多国家所使用的方法。
