净化工作台原理的洁净环境是在特定的空间内，洁净空气(进滤空气)按设定的方向流动而形成的。以气流方向来分，现有的超净工作台可分为垂直式，由内向外式以及侧向式。从操作质量和对环境的影响来考虑，以垂直式较优。由供气滤板提供的洁净空气以一个特定的速度下降通过操作区，在大约操作区的中间分开，由前端空气吸入孔和后吸气窗吸走，在操作区下部前后部吸入的空气混合在一起，并由鼓风机泵入后正压区，在机器的上部，30%的气体通过排气滤板从顶部排出，大约70%的气体通过供氧滤板重新进入操作区。为补充排气口排出的空气，同体积的空气通过操作口从房间空气中得到补充。这些空气不会进入操作区，只是形成一个空气屏障。
消毒方式：
超净工作台一般是用紫外线灭菌灯进行消毒的。
无菌室应定期用70%酒精或0.5%苯酚喷雾降尘和消毒，用2%新洁尔*抹拭台面和用具（70%酒精也可）。
用****（40%甲*）加少量高锰酸*定期密闭熏蒸，配合以使无菌室经常保持高度的无菌状态。
紫外线较长时间开启时，可激发空气中的氧分子缔合成臭氧分子，这种气体成分有好的杀菌作用，可以对紫外线役有直接照到的角落产生灭菌效果。
由于臭氧有碍健康，建议在进入操作之前应先关闭紫外线灯，10分钟后即可入内。 
