(一)、高效液相色谱仪在石油化工领域的应用：
高效液相色谱分析仪在石油生产鉴定中占有重要的作用，在石油化工，农药，环保等方面，经常采用薄层色谱法(TLC)和气相色谱法(OC)进行含量测定，而液相色谱法(LC)只是用于对组分标样的测定和分离的可能性的研究。近几年来，HPLC在油品分析，尤其是在石油中多环芳烃、重质烃的测定方面取得了突破性的进展。以正己烷、二氯甲烷为流动相，用多维高效液相色谱技术及适宜的梯度，实现了烃族良好的分离和检测。
(二)、高效液相色谱仪在生命科学领域的应用：
生命科学研究工作中，大的难题就是基因的解密工作，从基因组DNA序列尚不能回答某基因的表达时间、表达量、蛋白质翻译后加工和修饰的情况、以及它们的亚细胞分布等等。现代蛋白质组的分析可尝试使用第一向是体积排阻色谱的双向HPLC高效液相色谱作预分离。高效液相色谱和双向电泳将会成为蛋白质组学的重要分离工具。此外，在使用HPLC-MS测定人血浆中的依那普利及相对生物利用度和人体药学动力学研究时，采用高效液相色谱质谱方法，电喷雾电离源正源选择离子峰检测，检测效果明显。
(三)、高效液相色谱仪在环境领域的应用：
西方发达国家将HPLC方法作为常用的环境监测方法。如美国EPA531方法，用高效液相色谱-荧光法测定饮用水中的N一甲基氨基甲酸酯杀虫剂;EPA605方法用HPLC/电化学法测废水中的联苯胺类化合物;EPA8310方法用LC/荧光分析固体废弃物中的多环芳烃，就连气体中的有害有机物不少也是用HPLC测定。HPLC已在环境分析中得到广泛应用，特别适用于低挥发性、分子量大、热稳定性差的有机污染物质的分离和分析。如多环芳烃、酚类、多环联苯、邻苯二甲酸酯类、联苯胺类、阴离子表面活性剂、有机农药、除草剂等。
(四)、高效液相色谱仪在医药领域的应用：
近年来高效液相色谱法在药物分析中占主要地位，据美国药典22版载，HPLC在含量测定方法中位居第一。按照在药物分析中的应用，高效液相色谱仪主要有四个作用：①分离分析药物的组分含量：由于一种药剂常含有多组分，色谱方法是既能分离又能定量的方法；②药物生产中进行中间控制：生产抗菌素时，首先要了解发酵液中的主体与付产物的存在情况；③分析药物在体内的残量，这是近来研究新药效能很主要的内容之一。如冬凌草甲素是植物中的一组分，有抗癌效果，但是毒性大，测定其在血清中含量很重要；④测定药物在各种器官中的代谢产物，特别是研究药物的代谢产物在血清中存在的情况。
(五)、高效液相色谱仪在食品领域的应用：
食品安全问题一直是所有消费者都共同关注的问题，随着利益化的驱动，食品安全问题在近年来越来越突出，检验食品安全成为一项极为重要的程序。高效液相色谱法是食品检测中具有代表性的一种方法，主要是针对食品中的碳水化合物、维生素、蛋白质、氨基酸、添加剂、激素、霉菌毒素、农药残留、兽药残留、无机成分等进行分析，保障食品安全。
综上所述，高效液相色谱仪主要是采用新的科研技术，在化工生产和制药上占有的水平，在生物化工、食品安全、医学和环境等领域也获得了广泛的应用和推广。与一般的检测方法相比，高效液相色谱仪分析其特点是分析速度快、分离效率高、检测灵敏度高、检测自动化、适用范围广、组分易回收、样品处理较简单，具有更好的可行性和准确性。社会科技发展越来越迅速，对于物质的分析检测更加看重，高效液相色谱分析不仅具有研究意义，还有相当长的发展前景。
