普通质谱和高分辨质谱的区别，直观一点可以说是：能够将测得离子质量数，精确到小数点后两位和后六位的区别。高分辨质谱能够将分子量相差很小的两种物质进行区分，从而精确推断分子元素。厉害的高分辨质谱甚至可以取代部分元素分析。由M=n*(H)+n*(C)+n*(O)， m与n是正整数或者0，可知：M的小数点后的数值越准确，相应的m和n就可以排列出来。因此，高分辨质谱测出的数据，可以对物质结构加以确认。
高分辨质谱的应用和需求
月球研究、地质科学、生命科学、核工业、材料科学等领域对高分辨质谱的需求日益旺盛。
月球研究方面，我国规划在2030年前建立国际月球科研站，需要把质谱仪送到地外星球进行探索；地质矿产方面，地质矿产中，伴生元素复杂，且含量比较低，伴生元素和痕量检测非常需要高分辨质谱；核工业方面，核工业的磁质谱一直受到国外的技术壁垒，核工业的高质量发展急需自主高分辨质谱的发展；材料科学方面，材料科学、地矿、半导体、高温合金等对材料的纯净度要求越来越高，痕量和超痕量元素测量需要高分辨质谱。生命科学方面，目前生命科学研究已经发展到干细胞范畴，轨道阱也成了蛋白质组学、脂质组学、代谢组学研究的利器。生命科学、药物研发、临床质谱必然离不开高分辨质谱。
高分辨质谱的分类
高分辨质谱主要包括：双聚焦磁质谱、飞行时间质谱、轨道阱质谱和傅里叶变换离子回旋共振质谱。
按照分辨率级别的排序大概是这样：
1.（分辨率大概在1w级别）双聚焦磁质谱
同位素定量能力准，正向双聚焦高分辨率4w，反向双聚焦高分辨率10w
2.（分辨率大概在10w级别）飞行时间质谱
检测速度快，随着多次离子反射技术的引入，飞行时间质谱的高分辨率已经突破60w
3.（分辨率大概在100w级别）轨道阱质谱
高分辨率可达100w，比FTICR稍差，不需要昂贵的冷却装置
4.（分辨率几百万甚至更高）傅里叶变换离子回旋共振质谱（FTICR）
质量测量的精度高，分辨率可达数百万甚至更高，同时由于需要在液氦低温环境中运行，液氦成本高昂，所以操作维护成本昂贵。
