全自动PCR仪和手工PCR各有优缺点，下面进行对比分析：
操作简便性：全自动PCR仪操作相对简单，能够自动完成一些列的实验过程，如样本裂解、核酸提取纯化等，全程无需人工操作或干预。而手工PCR则需要经过复杂的实验流程，需要专业人员人工操作，对操作人员的专业素质要求较高。
实验效率：全自动PCR仪具有更高的自动化程度和更快的实验时间。它可以同时处理多个样本，实现高通量、高效率的核酸检测。而手工PCR通常只能处理一个或几个样本，实验效率相对较低。
实验质量：全自动PCR仪采用精密的温控和光学检测技术，能够更准确地控制实验条件，提高核酸检测的准确性和稳定性。而手工PCR受操作人员的技术水平、实验环境等因素的影响，可能导致实验结果存在一定的误差。
成本投入：全自动PCR仪的初始投入成本较高，但后期维护成本相对较低，可以减少人力成本。而手工PCR虽然成本较低，但需要更多的人力投入，同时实验损耗也相对较大。
适用范围：全自动PCR仪适用于大规模、标准化的核酸检测，尤其适用于临床诊断、疾控中心等场景。而手工PCR则适用于一些小规模、定制化的核酸检测，如某些科研项目。
综合来看，全自动PCR仪和手工PCR各有其适用场景和优劣，全自动PCR仪适用于大规模、标准化的核酸检测，可以减少人力成本和提高实验效率；而手工PCR则适用于一些小规模、定制化的核酸检测，可以更具灵活性和实验需求进行调整。
