从气流流向分为：垂直流洁净工作台和水平流洁净工作台；洁净工作台从操作人员数上分：分为单人工作台和双人工作台；洁净工作台从结构上分：分为常规型和新型推拉以及自循环型（仅限垂直流）。
洁净工作台根据气流的方向分为垂直流洁净工作台(vertical flow clean bench)和水平流洁净工作台(horizontal flow clean bench)，垂直流工作台由于风机在顶部所以噪音较大但是风垂直吹多用在医药工程这样保证人的身体健康；水平流工作台噪音比较小风向往外所以多用在电子行业，对身体健康影响不大。根据操作结构分为单边操作及双边操作两种形式，按其用途又可分为普通洁净工作台和生物(医药)洁净工作台。
