真空冷冻干燥机由干燥箱、制冷系统真空系统、媒体换热循环系统、自动控制系统、气动系统及在位清洗和消毒系统组成。
干燥箱
干燥箱是真空密闭低压容器，材料全部采用不锈钢，能承受正负压，符合蒸汽灭菌的要求,密封采用耐高温、耐低温的硅橡胶，保温层采用闭泡弹性绝热保温材料。
1)箱体：采用空间利用率高的矩形箱体，底部设置排水口，侧面开一观察窗，箱体上还装有压力计、测温电阻、放气阀、渗气阀、安全阀、喷淋进口接头。
2)搁板：食品的降温与开温所需的能量都是通过换热媒体传导给搁板，再到食品。搁板采用特殊空心夹板，强度高，密封性好。搁板组件通过支架安装在冻干燥箱内，最上层要设置一块板层作为热量辐射补偿板，确保箱内食品的空间都处在相同的温度环境下，另外，搁板两侧和后面都设置挡轨，以避免食品盘或食品脱离搁板。
3)箱门：采用气缸自动锁紧装置。确保箱体内部减压过程中所需要的真空度。真空泵工作时打开千箱蝶间，真空干燥室内的空气及水蒸汽经过捕水器捕提水分后进入真空泵，由真空泵排气口排出系统，在真空泵的排气口装有油雾捕集器，以防止排出气体中的烟雾污染室内环境。为了防止水蒸气进入泵内，系统配置了气镇阀，干燥过程中打开气镇阀。
媒体换热循环系统
食品的降温与升温所需的能量都是由循环泵驱动通过换热媒体传导给搁板，再到食品。食品降温的冷源由制冷系统提供，食品升温的热源由加热罐提供，降温与升温的切换通过控制冷源和热源的电磁阀门开关来完成。升温时蒸汽进人加热罐加热媒体，用气动三通调节阀调节来自加热罐的热媒和搁板回流热媒的混合比，并控制板式换热器冷却水电磁阀的开闭来控制搁板的温度。系统有热媒加热罐板式换热器，气动调节阀、冷却水电磁阀、循环泵、管路、电磁阀、温度传感器等。
自动控制系统
具有冻干曲线设定，真空泵测试与控制，媒体温度、食品温度捕水器温度控制，干燥状态检测，除路，在位清洗灭菌，自动保护和报警等功能。
气动系统
控制气动阀门
在位清洗和消毒系统
用于干箱捕水器的清洗和蒸汽消毒
