分子杂交仪是一种重要的实验设备，采用核酸分子杂交技术检测待测基因组中是否含有已知基因序列。它广泛应用于克隆基因的筛选、酶切图谱的制作、基因组中特定基因序列的定性、定量检测和疾病的诊断等方面。其基本原理是利用核酸分子的变性和复性性质，使来源不同的DNA(或RNA)片段按碱基互补关系形成杂交双链分子。
在分子杂交过程中，互补的DNA单链能够在一定条件下结合成双链，即进行杂交。这种结合是特异的，严格按照碱基互补的原则进行，既能在DNA和DNA之间进行，也能在DNA和RNA之间进行。因此，当用一段已知基因的核酸序列作为探针，与变性后的单链基因组DNA接触时，如果两者的碱基配对，它们即互补地结合成双链，从而表明被测基因组DNA中含有已知的基因序列。
分子杂交仪具有多种特点。例如，它采用微机控温，具有精确的温度控制功能；使得升温速度快；同时，它能够避免杂交袋破损带来的污染危险。此外，分子杂交仪在基因组学研究、蛋白质分析、病原体检测等方面都有重要的应用。例如，通过分子杂交技术，科研人员可以研究蛋白质的结构、功能和相互作用关系，为生物医药领域的药物研发和疾病治疗提供重要支持。
在操作上，分子杂交仪通常需要先接通电源打开开关，进行参数设定，达到所设定的温度后试运行一段时间，然后将所要杂交的样本放到仪器内开始运行。
