气相色谱柱在石油、化工、生物化学、医药卫生、食品工业、环保等方面应用很广。气相色谱柱的极性可以影响化合物在柱子中的保留时间和分离效果。极性柱的表面具有电性，可以吸附带有电荷的分子，例如天然物、极性物、对称物、小分子和活性成分等。而非极性柱的表面则没有电性，只能通过静电作用吸附小分子。
极性色谱柱和非极性色谱柱的差异主要体现在以下几个方面：
1.分离选择性
极性色谱柱在分离亲极性物质、水溶性化合物、多酚类等样品时表现出良好的分离选择性，而非极性色谱柱能够更好地分离脂肪类、芳香烃、不饱和脂肪酸等化合物。
2.分离度
极性色谱柱的流动相极性较高，因此在分离多种组分的混合物时，固定相对流动相的亲和力在一定程度上会损失，使得少部分弱极性化合物分离能力差。而非极性色谱柱的固定相对流动相的亲和力较强，在各种化合物的混合物分离中，其分离效果更优。
3.分析速度
极性相色谱柱因其极性特点，分离较快，但往往难以掌握分离条件时的反应，因此比较考验实验分析者的技术水平；而如非极性色谱柱的条件控制好，其分离速度较为稳定和快速。
