1、许多热敏性的物质不会发生变性或失活。在低温下干燥时，物质中的一些挥发性成分损失很小。
2、在冻干过程中，微生物的生长和酶的作用无法进行，因此能保持原来的性状。
3、由于在冻结的状态下进行干燥，因此体积几乎不变，保持了原来的结构，不会发生浓缩现象。
4、由于物料中的水在预冻后以冰晶的形式存在，溶解在水中的无机盐均匀分布在物料中。升华过程中，溶解在水中的溶解物质会沉淀，避免了一般干燥方法中，由于内部水分向表面迁移，导致无机盐在表面沉淀而导致表面硬化的现象。
5、原位冻干机干燥后的物质疏松多孔，呈海绵状，加水后溶解迅速而完全，几乎立即恢复原来的性状。
6、由于干燥在真空下进行，氧气很少，因此一些易氧化的物质得到了保护。
7、干燥能排除95%～99%以上的水分，使干燥后产品能长期保存而不致变质。
8、由于物料冻结，温度很低，所以对热源温度要求不高，采用常温或低温加热器都能满足要求。如果把冷冻室和干燥室分开，干燥室就不需要保温，不会有很大的热量损失，所以热能的利用是非常经济的。
