一个完整的移液器移液过程需以下几个步骤：密封性的检查、吸液嘴的安装、量程的调节、吸液嘴的润洗、移液（包括吸液和排液）、卸掉吸液嘴等。具体操作如下：
1. 密合性检查
可以用目视法检测：将吸取液体后的移液器垂直静置（5 ～ 10）s，观察是否有液滴缓慢的流出。若有流出，说明有漏气现象。
2. 吸液嘴安装
正确的安装方法叫旋转安装法。将移液器的吸液嘴连接管顶端垂直插入吸液嘴中，在轻轻用力下压的同时，左右微微（或小幅度）转动，但不能用力过猛，使其紧密结合，上紧即可。如果是多通道（如 8 通道或 12 通道）移液器，则可以将移液器的第一道对准第一个吸液嘴，然后倾斜地插入至全部通道与对应的吸液嘴紧密接触，往前后方向摇动即可卡紧。
吸液嘴卡紧的标志是略微超过 O 型环，并可以看到连接部分形成清晰的密封圈。
3. 量程的调节
在调节量程时，通过旋转按钮将容量值迅速调整至接近被测量值；当容量值接近要测的量值后，应将移液器横置，水平放至眼前，通过调节按钮慢慢地将容量值调至测量值，从而避免视觉误差所造成的影响。应当注意的是：（1）由于移液器的计数器内部有空隙产生，所以在调节被测量值时，需要先调至超过被测量的量值后再回调至被测量值，这样可以保证最佳的准确度。（2）在调节测量值的过程中，不能将按钮旋出最大或最小量程的位置，否则会卡住内部机械装置而损坏移液器。
4. 吸液嘴的润洗
吸液嘴在检定之前，先吸取或排放蒸馏水至少1～3次，将其润湿。这是为了让吸液嘴内壁形成一道相同介质的液膜，确保移液器移液工作过程的准确一致性和重复性。
5. 移液（吸液与排液）
由于吸液嘴浸入液面深度不同，造成的不同液压会影响移液器的准确度，所以依据不同的量程其吸液嘴浸入深度和停留时间也不同。
