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2024/5/11 10:52:36蛋白质结晶是研究蛋白质结构和功能的关键手段,对理解生物大分子作用、疾病机制及药物开发至关重要。它涉及蛋白质分子在溶液中规则堆积形成有序晶体的过程,受蛋白质纯度、浓度、缓冲液成分等多种因素影响。为获高质量晶体,需进行样品制备、条件筛选与优化等。蛋白结晶研究推动生物学和医学领域发展,支持药物设计和蛋白质工程。本文概述了蛋白质结晶的制备、方法、筛选、优化等要点,为相关研究提供参考。
一 蛋白质晶体的发展史
蛋白质晶体的研究始于19世纪中期,Hunefeld首先报道了血红蛋白晶体。到了20世纪,结晶技术成为提纯和研究蛋白质的重要方法,特别是John Jacob Abel对胰岛素的结晶,以及James B. Sumner对酶作为晶体蛋白质的确认。1930年代末,蛋白质晶体开始用X射线分析,开启了结构生物学的新篇章。随着遗传学和分子生物学的发展,特别是DNA技术的应用,蛋白质晶体的研究在1980年代后得到了极大的加速和变革。
二 蛋白结晶:艺术与科学的结合
尽管现代分子生物学和晶体学的进步为许多实验提供了便捷,但蛋白质结晶仍然是一个既简单又复杂的挑战。这一过程结合了科学的方法与艺术般的直觉和创造力,然而又高度依赖经验的积累。
由于生物大分子(如蛋白质)由大量不同原子以复杂方式组合,结晶过程中存在诸多变量和影响因素。这些因素包括蛋白质纯度、浓度、pH值、离子强度等,每一个变量都可能对结晶结果产生显著影响(表1和2)。
表1. 影响蛋白质晶体生长的化学变量 | |||
样品的纯度 | 基因修饰 | ||
样品的构象灵活性 | 分子的对称性 | ||
样品的均一性 | 样品的稳定性和变性程度 | ||
PH值和缓冲液 | 等电点 | ||
沉淀剂的类型和浓度 | 存在his标签和其他纯化标签与否 | ||
样品的浓度 | 热稳定性 | ||
添加剂、辅助因子、配体、抑制剂、效应剂和辅料 | PH稳定性 | ||
混沌剂,如尿素、盐酸胍、硫酸铵等 | 样本的获取、处理、保存等历史过程 | ||
洗涤剂 | 蛋白水解 | ||
金属离子 | 微生物污染 | ||
离子强度 | 样品保存 | ||
还原剂或氧化剂 | 样品处理及相关的清洁度 | ||
样品是来源 | 阴、阳离子类型及浓度 | ||
无定形颗粒物质 | 相对过饱和度 | ||
翻译后修饰 | 其他试剂的初始浓度和最终浓度 | ||
化学修饰 | 平衡的路径和速率 | ||
表2.可能或确实影响蛋白质晶体生长的物理变量 | |||
温度 | 电磁场 | ||
平衡速率 | 结晶装置的表面 | ||
结晶方法 | 试剂的粘度 | ||
重力、对流和沉降 | 异质和外延成核剂 | ||
振动和声音 | 结晶装置的几何形状 | ||
样品和试剂的体积 | 时间 | ||
压力 | 试剂的介电性能 | ||
结晶实验通常从筛选开始,旨在找到能产生晶体的关键变量组合。然而,为了获得具有特定特性的晶体(如用于结构生物学、纯化或生物治疗研究),往往需要进一步的优化实验(表3和表4)。
表3.结晶方法-过饱和度的实现 | ||
气相扩散法(Sitting, Hanging, Sandwich) | 序列提取(数据处理和分析技术) | |
分批结晶法(微分批结晶) | pH诱导(简单、可控) | |
透析技术 (微透析技术发挥辅助作用) | 温度诱导(操作简便、成本较低,需与其他方法结合使用) | |
自由界面扩散(逆扩散, 液桥) | 效应物添加(也加Silver Bullet) | |
控制蒸发 | ||
表4.蛋白质结晶所用试剂 | ||
盐类 (硫酸铵、甲酸钠、磷酸铵等) | 非挥发性有机物((±)-2-甲基-2,4-戊二醇、1,6-己二醇、甘油等) | |
聚合物 (聚乙二醇、分子量范围在200到20,000之间、乙烯亚胺、杰凡尼®等) | 缓冲液 (HEPES、Tris、醋酸钠、MES等) | |
挥发性有机物 (2-丙醇、1,4-二氧六环、乙醇等) | 添加剂 (氯化钙、氯化钠、三(2-羧乙基)膦、n-辛基-β-D-葡糖苷等) | |
尽管现代技术提供了丰富的资源和工具,但结晶并非仅仅是使用这些工具那么简单。成功的结晶策略需要基于一些基本原则,正如Alex McPherson等结晶领域的先驱所提出的,在进行实验之前,考虑这些原则将为您的结晶工作提供坚实的基础。
三 蛋白结晶的关键要素
样本:样本的纯度是结晶成功的基石,需细致处理以保证样本高均一性。
均一性:蛋白质样品的化学结构和分子量的一致性对形成有序晶体至关重要。
溶解度:优化样本在缓冲液中的溶解条件,追求单分散性,避免聚集和沉淀。
稳定性:确保蛋白质在结晶过程中保持结构和功能稳定,避免变性。
超饱和:通过控制超饱和度,诱导蛋白质分子有序排列形成晶核。
缔合:调控蛋白质分子间的有序相互作用,促进有序聚集,避免非特异性聚集。
成核:控制溶液中蛋白质初始结晶核的形成,以优化晶体数量、大小和质量。
多样性:尝试多种方法和条件来发现适合特定蛋白质的结晶条件。
控制:精确调控实验条件和过程,确保实验结果的准确性和可重复性。
杂质:保持样品纯度,减少杂质对结晶和后续研究的干扰。
保存:妥善保护结晶出的蛋白质晶体,防止其受到损害,确保后续研究的可靠性。
美国Hampton Research公司是一家专注于蛋白质晶体研究的生产商,其广泛的产品组合涵盖了从结晶初步筛选到结晶优化筛选,再到定制单组分结晶试剂和结晶生长优化试剂等产品。这些产品能够满足不同蛋白结晶研究的需求,包括普通蛋白、膜蛋白以及蛋白复合体的结晶。
Hampton Research以生物大分子结晶技术和实用丰富的产品线,为全球晶体研究人员提供了全面的晶体研究试剂和实验耗材。这些产品不仅极大地提升了科研人员的工作效率,而且帮助他们取得了的众多科研成果,Hampton Research已成为晶体研究领域备受信赖的品牌之一。
西美杰Hampton Research蛋白结晶热销产品
Hampton Research蛋白结晶筛选试剂盒
品牌 | 货号 | 品名 | 规格 | 简介 |
Hampton | HR2-144 | Index | 10 ml, tube format | 蛋白质、络合物、多肽、核酸和水溶性小分子等多种试剂体系的经典结晶条件初筛选试剂盒,包含96个条件 |
Hampton | HR2-110 | Crystal Screen | 蛋白、可溶性多肽、核酸和水溶性小分子等多种试剂体系结晶条件初筛试剂盒,包含50个条件 | |
Hampton | HR2-112 | Crystal Screen 2 | 10 ml, tube format | 蛋白、可溶性多肽、核酸和水溶性小分子等多种试剂体系结晶条件初筛试剂盒,包含48个条件 |
HR2-114 | MembFac | 10 ml, tube format | 适用于膜蛋白的结晶条件初筛试剂盒,包含48个条件 | |
Hampton | HR2-116 | Natrix | 10 ml, tube format | |
Hampton | HR2-117 | Natrix 2 | 10 ml, tube format | 核酸、核酸/蛋白质复合物结晶条件初筛试剂盒,包含48个条件 |
Hampton | HR2-082 | PEGRx 1 | 10 ml, tube format | 聚合物和pH条件初筛与二次筛选试剂盒,包含48个条件 |
Hampton | HR2-084 | PEGRx 2 | 10 ml, tube format | 聚合物和pH条件初筛与二次筛选试剂盒,包含48个条件 |
Hampton | HR2-126 | PEG/Ion Screen | 10 ml, tube format | 聚合物、盐和pH条件初筛与二次筛选试剂盒,包含48个条件 |
HR2-098 | PEG/Ion 2 Screen | 10 ml, tube format | 聚合物、盐和pH条件初筛与二次筛选试剂盒,包含48个条件 | |
Hampton | SaltRx 1 | 10 ml, tube format | 盐和pH条件初筛与二次筛选试剂盒,包含48个条件 | |
Hampton | HR2-109 | SaltRx 2 | 10 ml, tube format | 盐和pH条件初筛与二次筛选试剂盒,包含48个条件 |
除上述产品外,西美杰还提供包括GRAS Screen™、Grid Screen系列、Low Ionic Strength Screen、XP Screen、JBScreen Wizard等等在内的多种结晶条件筛选试剂盒。
Hampton Research蛋白结晶优化试剂盒
品牌 | 货号 | 品名 | 规格 | 简介 |
Hampton | HR2-072 | Solubility & Stability Screen | 0.5 ml, Deep Well block format | 溶解度和稳定性筛选,包含96个条件 |
HR2-413 | Solubility & Stability Screen 2 | 0.5 ml, Deep Well block format | 溶解度和稳定性筛选,包含96个条件 | |
Hampton | HR2-070 | Slice pH | 0.5 ml, Deep Well block format | pH筛选试剂盒,包含96个条件 |
Hampton | HR2-138 | Additive Screen | 1 ml, Deep Well block format | |
Hampton | HR2-459 | GRAS Additive | 1 ml, Deep Well block format | GRAS添加剂筛选,包含96个条件 |
Hampton | HR2-096 | Silver Bullets | 0.50 ml, Deep Well block format | 添加剂筛选试剂盒,包含96个条件 |
Hampton | HR2-407 | Detergent Screen | 0.25 ml, Deep Well block format | 洗涤剂筛选试剂盒,包含96个条件 |
Hampton | HR2-214 | Ionic Liquid Screen | 0.5 ml, tube format | 离子液体筛选试剂盒,包含24个条件 |
Hampton | HR2-241 | StockOptions pH | 10 ml, tube format | 晶体生长筛选试剂盒,包含45个条件 |
Hampton | HR2-235 | StockOptions Sodium Citrate | 10 ml, tube format | 晶体生长筛选试剂盒,包含24个条件 |
Hampton | HR2-239 | StockOptions Sodium Cacodylate | 10 ml, tube format | 晶体生长筛选试剂盒,包含24个条件 |
Hampton | HR2-243 | StockOptions MES | 10 ml, tube format | 晶体生长筛选试剂盒,包含20个条件 |
Hampton | HR2-103 | StockOptions Bis-Tris Propane | 10 ml, tube format | 晶体生长筛选试剂盒,包含33个条件 |
Hampton | HR2-102 | StockOptions HEPES | 10 ml, tube format | 晶体生长筛选试剂盒,包含15个条件 |
Hampton | HR2-227 | StockOptions Polymer | 10 ml, tube format | 晶体生长筛选试剂盒,包含23个条件 |
Hampton | HR2-245 | StockOptions Salt | 10 ml, tube format | 晶体生长筛选试剂盒,包含49个条件 |
HR2-073 | CryoPro | 1 ml, tube format | 晶体冷冻保护剂筛选,包含48个条件 | |
Hampton | HR2-501 | 50% v/v Jeffamine® M-600® pH 7.0 | 200 ml | 结晶级Jeffamine M-600用于结晶条件优化 |
Hampton | HR2-525 | 50% w/v Polyethylene glycol 1,500 | 200 mL | 结晶级PEG 1500用于结晶条件优化 |
Hampton | HR2-527 | 50% w/v Polyethylene glycol 3,350 Monodisperse | 200 mL | 结晶级PEG 3350用于结晶条件优化 |
Hampton | HR2-529 | 50% w/v Polyethylene glycol 4,000 | 200 mL | 结晶级PEG 4000用于结晶条件优化 |
以上试剂盒中的单组分条件可单独订购。除上述试剂盒外,西美杰还提供包括Proti-Ace™、Silica Hydrogel Kit、Heavy Atom Screens、I3C Phasing Kit等多款结晶优化筛选试剂盒及试剂。
Hampton Research蛋白结晶耗材工具
品牌 | 货号 | 品名 | 规格 | 简介 |
HR2-320 | Seed Bead Kit | 24 tubes with PTFE Seed Bead | 晶种制备珠 | |
Hampton | HR3-105 | MASTERBLOCK® 96 Deep Well polypropylene plate | 50 plate case | 96孔深孔板 |
Hampton | HR3-081 | 72 Well Microbatch Plate, Greiner 654102 | untreated, hydrophobic - 270 plate case | 72孔油下结晶板 |
Hampton | HR3-125 | Swissci 3 Well Midi Crystallization Plate in UVP (40) | 40 plate case | 3微孔/96孔坐滴板 |
Hampton | HR3-158 | Cryschem Plate | 24 plate case | 24孔坐滴板 |
Hampton | HR3-231 | 22 mm x 0.22 mm Siliconized circle cover slides | 1.0 ounce pack (~120 slides) | 圆形硅化玻璃盖玻片 |
Hampton | HR3-233 | 22 mm x 0.22 mm Siliconized circle cover slides | 10.0 ounce case (~1,200 slides) | 圆形硅化玻璃盖玻片 |
Hampton | HR3-609 | Crystal Clear Sealing Film | 100 pack | 结晶板封口膜 |
Hampton | HR4-216 | Crystal Crusher | 5 pack | 晶体粉碎器 |
Hampton | HR4-217 | Crystal Probe | 12 pack | 一次性不锈钢晶体针 |
Hampton | HR4-733 | CrystalCap | with Vial - 60 pack | 晶体环底座 |
Hampton | HR4-811 | Micro-Tools Set | each | 晶体处理工具套装,含8个不同形状的晶体探针 |
除上述产品外,西美杰还提供各种规格结晶板、loop、微桥、密封胶,Pucks等工具耗材及整套工具箱,帮助研究人员更快更高效的开展实验。
西美杰作为Hampton Research在中国的授权代理,致力于为用户提供周到的技术支持和售后服务。西美杰始终秉持“We promise what we can do. We do what we have promised”的核心理念,为用户提供优质的服务。
References and Readings
1.Der Chemismus in der tierescher Organization, Hunefeld, F 1. (1840)p.160.Leipzig University, Germany.
2.A brief h istory of protein crystal growth, MePherson, A. (1991). J. Cryst.Growth, 110,1-10.
3 über die Eiweisskorper verschiedenen Oelsamen, Ritthausen, H. (1880)Pfluegers Arch. 21,81-104.
4 The proteins of the Brazil nut, Osborne T.(1891). Am. Chem. J. 13,212-218.
5 Crystalline insulin., Abel, 」.J., Geiling, E. M. K., Roultier, O. A., Bell, F. M.&Wintersteiner, 0.(1927).]. Pharmacol. Exp. Ther. 31,65-85.
6 The Enzymes, Sumner, J.B.& Somers, G.F(1943). New York: Aca-demic Press.
7 Crystalline enzymes, Northrop, M., Kunitz, M. & Herriott, R. M. (1948)New York: Columbia University Press.
8 Present at the flood: How structural molecular biology came about,Dickerson,R.E.(2005).FASEB J.20,809-810.
9 Preparation and Analysis of Protein Crystals, McPherson, A.(1982)New York: lohn Wiley & Sons.
10.Current approaches to macromolecular crystallization. McPherson, A. (1990).Eur.Biochem.189,1-23.
11.Crystallization of Biological Macromolecules, McPherson, A.(1999)Cold Spring Harbor: Cold Spring Harbor Laboratory Press.
12Introduction to protein crystallization, McPherson, A. and Gavira, J.A.(2014) Acta Crystallographica F, Volume 70, Part 1, 2-20.
13.Some Words of Advice from an Old Hand, Alexander McPherson, pages1-9, in Protein Crystallization, Second Edition, Edited by Terese Berg-fors. International University Line, 2009.