Cyanine3活性酯(Cyanine3 NHS ester，也被称为CY3-NHS)是一种荧光染料，它具有一种N-羟基琥珀酰亚胺(N-hydroxysuccinimide, NHS)酯的功能团，这使得它能够与含有氨基的生物分子进行反应。
1. 结构：Cyanine3-NHS通常包含一个三环的荧光骨架，两个氮原子之间连有一个烷基或烯基桥。活性的NHS酯功能团连接在这个骨架上。NHS酯易于与氨基反应，形成稳定的酰胺键。
2. 性质：
- 荧光特性：Cyanine3-NHS在可见光的红色部分（550 nm）有最大的吸收波长，而发射波长则在570 nm左右。这种特性使得它可以在常规的荧光显微镜下观察。
- 化学反应性：NHS酯可以与氨基（赖氨酸残基的侧链，N末端氨基）反应，形成稳定的酰胺键。这种反应在中性或稍碱性的条件下进行，并且反应速度很快。
- 稳定性：Cyanine3-NHS在干燥、冷暗处保存时稳定性较好。然而，NHS酯在水或含有水的溶剂中会迅速水解，因此需要在无水条件下使用。
- 可溶性：Cyanine3-NHS在有机溶剂（如二甲基甲酰胺，DMSO）中可溶，但在水中不溶。
Cyanine3-NHS在生物学和医学研究中有许多应用，包括生物标记、细胞成像、流式细胞术、免疫荧光技术、FRET研究等等。
Cyanine3-NHS（CY3-NHS）是一个活化的荧光染料，它可以与生物分子中的氨基反应，用于生物标记和荧光显微镜成像。以下是CY3-NHS在生物标记上的应用：
1. 蛋白质标记：
CY3-NHS可以与蛋白质中的氨基反应，实现蛋白质的荧光标记。例如，在免疫荧光染色中，可以将CY3-NHS与抗体结合，然后将这些标记的抗体与待测样品中的特定蛋白质结合。通过检测CY3-NHS的荧光信号，可以可视化和定量分析目标蛋白质的存在和定位。
2. 细胞标记：
CY3-NHS可以与细胞表面的氨基反应，实现细胞的荧光标记。例如，在细胞成像研究中，可以将CY3-NHS与细胞表面的特定蛋白质结合，用于可视化和追踪该蛋白质在细胞内的分布和定位。这样可以研究细胞的结构和功能，以及细胞中特定蛋白质的动态变化。
3. 组织标记：
CY3-NHS可以与组织中的氨基反应，实现组织的荧光标记。例如，在组织切片成像中，可以将CY3-NHS与特定抗体结合，然后将这些标记的抗体与组织切片中的特定细胞类型或结构相结合。通过检测CY3-NHS的荧光信号，可以可视化和定量分析组织中的特定细胞类型或结构的存在和定位。
总之，CY3-NHS作为活化的荧光染料在生物标记中的应用主要包括蛋白质标记、细胞标记和组织标记等。通过与生物分子中的氨基反应，CY3-NHS实现了对生物分子、细胞和组织的荧光标记，以及荧光显微镜成像。这些应用为细胞生物学、分子生物学和组织学研究提供了重要的工具。
