自动化建库仪是用于高通量测序文库制备的先进设备,它集成了多个模块功能,以自动化和标准化的方式完成从样本到文库的制备过程。以下是自动化建库仪常见的模块功能:
样本处理模块:
负责样本的输入、初步处理和分配。
可以进行样本的标记、稀释、混合等操作。
核酸提取模块:
自动化进行样本中核酸(如DNA或RNA)的提取。
可能包括细胞裂解、蛋白去除、核酸纯化等步骤。
核酸定量与质量检测模块:
使用荧光定量或其他技术自动测量核酸的浓度。
评估核酸的质量,如完整性、纯度等。
文库构建模块:
负责将核酸片段化、末端修复、加接头(adapter)等文库构建的关键步骤。
可以进行PCR扩增以富集文库。
纯化模块:
通过磁珠或其他方法自动纯化DNA片段,去除杂质和未反应的试剂。
可能包括洗涤、磁吸分离等步骤。
热循环模块:
提供PCR扩增所需的精确温度控制和时间控制。
可以进行多步PCR反应,确保文库构建的准确性。
液体处理模块:
负责精确移液、混合、分配等操作。
使用高精度的移液系统和自动化算法确保液体处理的准确性。
条码标记模块(可选):
对于需要多个样本混合测序的实验,可以在文库构建过程中添加样本特定的条码标记。
便于后续数据分析时区分不同样本。
数据记录与监控模块:
记录整个实验过程的数据,包括试剂用量、温度、时间等。
实时监控实验进程,确保实验的顺利进行。
安全防护模块:
提供生物安全防护措施,如HEPA过滤、紫外线消毒等。
确保操作人员的安全,减少交叉污染的风险。