水套式二氧化碳培养箱是指一种依靠腔壁内加热的水来保持整个培养箱温度均匀的材料，由于水的高热容量，它们能够较长时间保持所需的温度，这对于多次开门或停电是有益的。
水套式二氧化碳培养箱缺点：
填充和加热培养箱可能需要时间，因此水套培养箱需要更长的启动过程。一旦腔室壁充满水，培养箱会变得非常重并且难以移动。考虑到停滞的温水是污染物生长的理想场所。
水套式孵化器的另一个缺点是藻类和细菌很容易在室内生长。此外，如果使用错误类型的水，培养箱可能会生锈，从而可能导致昂贵的维修费用。
这需要比气套式CO2培养箱多一点维护，因为水套式二氧化碳培养箱必须排空和清洁才能解决这个问题。
气套式CO2培养箱被认为是水套的替代品。它们更轻、设置更快、提供相似的温度均匀性并且通常需要更少的维护。它们在开门后提供更快的恢复。
这是因为空气夹套培养箱可以根据开门后腔室内的空气温度来调节温度开/关周期。气套式CO2培养箱也适用于高温灭菌，温度可达 180°C 以上，这是使用水套式二氧化碳培养箱无法实现的。
如果受到污染，可以通过传统的净化方法（如高温）或更有效的方法（如紫外线和 H2）快速净化空气夹套培养箱。
