酶标仪功能加大的内部软件，有包括中文在内的多种语言可供选择。软件功能包括：设置微孔板布局（包括空白、标准品、待测样品、质控品等），显示检测结果，进行数据处理（包括动力学分析、数据预处理、曲线拟合、数据分类、质控等）。此外，FC还可以与电脑相连，通过使用功能更强大的Skanlt软件对仪器进行控制和数据结果的分析处理。
吸收光检测：工作原理与主要结构和光电比色计基本相同，在特定波长下检测被测物的吸光值，称为光吸收检测（Absorbance，Abs）。只做吸收光检测的酶标分析仪实际上就是一台变相光电比色计或分光光度计，其基本工作原理与主要结构和光电比色计基本相同。光源发出的光波经过滤光片或单色器变成一束单色光，进入塑料微孔板中的待测标本。
该单色光一部分被标本吸收，另一部分则透过标本照射到光电检测器上，光电检测器将这一待测标本不同而强弱不同的光信号转换成相应的电信号，电信号经前置放大，对数放大，模数转换等信号处理后送入微处理器进行数据处理和计算，最后由显示器和打印机显示结果。特定波长下，同一种被检测物的浓度与被吸收的能量成定量关系，即符合朗伯比尔定律。
