结构上的区别
内置冷凝器：短程蒸发器严格意义上讲是一个具有内置冷凝器的薄膜蒸发器。而通常所说的薄膜蒸发器，其内部没有冷凝器，冷凝器是外置式的，与薄膜蒸发器的气相出口相连接。
气相出口位置：薄膜蒸发器的气相出口通常在蒸发器的顶部，因为轻组分的蒸汽是自下向上流动的。而短程蒸发器的气相出口在蒸发器的底部，这是因为在短程蒸发器内蒸发的轻组分要充分地在内置冷凝器上进行冷凝，成为液态从底部排出。
操作压力：由于短程蒸发器的内置冷凝器冷凝了绝大部分的气态轻组分至液态，能迅速地消除气态轻组分所产生的蒸汽压，因此短程蒸发器可以达到极低的操作压力，可达0.001mbar（0.1Pa）。而薄膜蒸发器的气相要经过一个气相管口进入外冷器，在气相管口处会产生较大的压力降，所以薄膜蒸发器内的蒸汽压力会较高，可达到1mbar（100Pa）。
刮膜转子设计：由于短程蒸发器有内置冷凝器，刮膜转子无法加底部轴承，是从顶部自由悬下来的，这限制了其处理高粘度物料的能力。而薄膜蒸发器的中心是空的，刮膜转子可以加底部轴承，转子的扭矩更大，稳定性更好，能处理从低粘度到高粘度的广泛物料。
应用上的区别
物料处理：短程蒸发器更加适合热敏性物料或高沸点物料的蒸馏，可以大大降低组分的沸点。但由于刮膜转子的设计限制，它主要适用于处理粘度较低的物料。而薄膜蒸发器则能处理更广泛的物料粘度范围。
应用领域：两者都广泛应用于化工、食品、医药等领域。但短程蒸发器在对高沸点物质、热稳定性差的化学品和高余量固体残留的处理中有优势。同时，它还可以用于纯化脱色、溶剂回收、精馏分离等多种领域。薄膜蒸发器则因其高效节能、操作简便等特点，在化工原料的回收和再利用、果汁酸奶等食品的蒸发浓缩、中药提取等方面有着广泛的应用。
