MLPA技术，即多重连接探针扩增技术，于2002年首先报道，是近几年发展起来的一种针对待检DNA序列进行定性和半定量分析的新技术。该技术高效、特异，在一次反应中可以检测45个核苷酸序列拷贝数的改变，已经应用于多个领域、多种疾病的研究。下面让我们一起来看看MLPA技术的试验原理吧！
在MLPA实验中，纯化的样本DNA被变性。之后用MLPA探针寡核苷酸孵育过夜。每个MLPA探针都具有针对特定基因组序列的探针。每对MLPA探针包括两条单链DNA:左侧探针和右侧探针寡核苷酸。简称分别是LPO和RPO。LPO和RPO包含PCR引物和DNA杂交序列。
在MLPA反应中，左探针寡核苷酸（LPO）和右探针寡核苷酸（RPO）都与靶序列进行杂交，之后使用连接酶连接两部分探针。
将杂交的探针寡核苷酸连接到邻近的目标序列。探针连接产物的数量是样品中目标序列数量的度量。连接反应具有高度特异性，连接部位周围没有错配。
使用单个通用引物对在多重PCR中扩增连接的探针。只有连接的探针呈指数级扩增，使得不需要去除未连接和未连接的探针。
再通过毛细管电泳进行片段分离，通过MRC Holland的分析软件进行分析得出结论。PCR产物装载到毛细管电置上，按长度分离。每个片段对应一个特定的MLPA探针。
MLPA结合了DNA探针杂交和PCR技术，不仅可以用来检测与疾病相关的CNV（拷贝数变异），例如遗传性乳腺癌、结肠癌、杜氏肌营养不良等，还可以用于肿瘤中的CNV检测，以优化肿瘤分型。任何技术都有其优缺点。
优点：
1、高效：一次反应可以检测45个靶序列拷贝数的改变。
2、特异：可以检测点突变。
3、快速：一次实验可以在24小时内完成。
4、简便：不同的试剂盒操作基本相同，容易掌握。
缺点：
1、需要精确测量DNA的浓度，样本容易被污染。
2、不能用于单个细胞的检测。
3、MLPA用于检测基因的缺失或重复，不适合检测未知的点突变类型。
4、不能检测染色体的平衡易位。
