厌氧反应器的上部设置气，固，液三相分离器，下部为污泥悬浮层区和污泥床区，废水由反应器底部均匀泵入污泥床区，与厌氧污泥充分接触反应，有机物被厌氧微生物分解成沼气。液体，气体与固体形成混合液上升至三相分离器，使三者很好地分离。使80%的以上的有机物被转化成沼气，完成废水处理的过程。
1、厌氧系统的关键控制点：
反应器需求：正常运行的反应器每次水量波动幅度不超过上次的20%，出现水量对厌氧处理系统产生影响一般发生在停产后生产的3~4天内，并很快恢复正常。
应对措施：污水站车间来水暂存，在集水池，调节池里预酸化，可以去除一部分COD，同时根据生产计划预计废水排放量，制定进水计划。间歇进水，但必须保证进水流量恒定。
1、进水COD负荷控制：
反应器需求：来水COD波动较大，但正常运行的反应器根据设计要求有恒定的污泥负荷要求。要求进水COD浓度尽可能恒定。
应对措施：充分利用调节池或事故池，对高COD废水进行稀释。充分发挥调节池的均质作用。同时减少进水时间，增大进水时间间隔，适当增加pH。必要时开循环泵稀释进水。
2、进水温度控制：
反应器需求：中温厌氧反应器最适宜的温度为30~35℃。在上述范围，温度在1~3℃的微小波动，对厌氧反应影响不明显。但温度骤变，刚会使污泥活性下降，产生酸积累问题。
应对措施：进水水温较低，且环境温度较低的工厂可以向调节池蒸汽加热等方式提高厌氧系统进水温度。保证厌氧进水温度至少在20℃以上。
3、进水pH值控制
反应器需求：正常运行的反应器内产酸菌和产甲烷菌的生存在一个酸碱的缓冲体系，所以厌氧反应应严格控制pH,即产甲烷菌的pH范围为6.8~7.2.
应对措施：通过调节池的调节和酸碱添加控制厌氧池进水的pH。越是在淡季水量低时越应控制pH值达到工艺要求范围，通过提高调节池和厌氧池进水的pH检测频率提高厌氧池的pH控制精度。
