微波对于不同的反应体系产生的作用不同，它不仅可以加热物质，而且还可以对产生一些比较细小的变化过程中，加速物质之间的作用，加快反应;也可以推迟物质之间的反应。从上述的总结来看，微波对反应体系的作用是一个相对复杂的过程，归纳如下：
1、加热效应
所谓的加热效应就是指微波在过程中可以对物质进行加热，大大提高了物质的反应速度。
微波加热其本质就是过程中的电磁能有效的转变成热能。他的转变和物质中分子的微观粒子的运动轨迹紧密相连，在但磁场的作用下会产生：电子极化、介电极化、取向极化和原子极化前两种极化的时间较长，在十秒到十二秒和十秒十三秒之间，要快于微波频率;后两种极化的时间则和微波的频率较为接近，可以将微波能转变成热能。
微波的强穿透性可以在物体的内部和外部同时进行加热，密闭容器的压力较大，温度在升高的过程中反应的速度也在不断的加快，这些都会推进化学反应的速度。
2、催化效应
很多的有机化合物不会直接的吸收微波，主要是通过某种强烈的吸收微波的媒介将微波能传递给相对应的物质进而引发化学反应，如果是可以在微波的照射下就可以出现的催化反应就是所谓的微波诱导催化反应，区分于普通的加热效应，他主要是通过催化剂和其他载体诱导发生的。
3、非热效应
化学的分支领域中微波已经开始广泛的应用了，与此同时，传统的微波加热效应也受到了强烈的冲击，通过实验人们发现微波对化学反应的影响受环境的制约的同时也和微波、化学反应密切相关。
微波可以加快反应，也可以抑制反应，也可以引导出现选择性的反应的发生。有人利用微波来合成磷酸锌，这个现象用加热效应是无法解释清楚的，在常规情况下，水溶性的磺化钛青铜是无法产生的，这也说明了非热效应的存在。
