我国在2021年连续出台了4部基因治疗相关产品的指导原则都指出慢病毒整合检测至少要包含1. 整合方向 2. 整合位置 3. 特定整合位置和整合方向的绝对克隆数目。Fig 1. Results of CBPL0002 by NGS (Probe capture method).通过NGS(捕获探针法测序)技术,结合生信分析方法,选取1000×以上Reads数的基因进行Sanger以及ddPCR法验证,同时采用ddPCR方法检测整合频率。多种方法相结合,准确定位慢病毒插入位点以及整合频率。Fig 2.Results of CBPL0002 by Sanger sequencing.
Fig 3.Results of CBPL0002 by ddPCR.
根据NGS(捕获探针法测序)结果确定慢病毒插入位点,通过Sanger测序以及ddPCR法再次验证,准确定位慢病毒插入位点以及整合频率。
CAR-T细胞疗法被认为是最有前途的癌症治疗方法之一,其在血液系统瘤中的运用已取得了优异的疗效,可靠的检测方法可以准确有效分析慢病毒插入位点,协助客户评估插入突变的可能性以及相关的风险,提高细胞免疫治疗的安全性。