高关联扫描电子显微镜(SEM)和光学显微镜是两种截然不同的显微镜技术，它们在多个方面存在显著差异。
一、照明源与成像原理
高关联扫描电子显微镜：
照明源：使用电子枪发射的电子束作为照明源。
成像原理：电子束聚焦后照射在样品表面，样品对电子的散射程度不同，在荧光屏或探测器上形成图像。电子束的波长极短，因此能够呈现极其细微的结构。
光学显微镜：
照明源：使用可见光(日光或灯光)作为照明源。
成像原理：光线透过标本，经过物镜和目镜的折射，将标本放大成像。不同结构对光的吸收、折射和反射不同，形成图像的明暗对比。
二、分辨率与放大倍数
高关联扫描电子显微镜：
分辨率：高，可达纳米级，甚至能够观察到原子、分子水平的微观细节。
放大倍数：范围广泛，从几倍到数十万倍不等，可根据需要进行调整。
光学显微镜：
分辨率：受可见光波长限制，一般在微米级，难以分辨距离小于光波长一半的物体。
放大倍数：通常较低，有效放大倍数一般在1000倍左右。
三、景深与视野
高关联扫描电子显微镜：
景深：较长，能够在不同深度进行扫描和分析，观察到样品内部结构。
视野：相对较小，但可通过调整扫描范围来改变。
光学显微镜：
景深：较短，对样品表面的光滑程度有较高要求。
视野：较大，适用于观察较大范围的样品。
四、标本制备要求
高关联扫描电子显微镜：
标本制备复杂，需要将标本切成极薄的薄片(一般几十纳米厚)，并经过固定、脱水、包埋、染色等一系列精细处理。
光学显微镜：
标本制备相对简便，生物标本可通过涂片、切片或装片的方式固定在载玻片上。
五、应用领域
高关联扫描电子显微镜：
在前沿科学研究中发挥关键作用，如生物领域研究蛋白质结构、病毒形态；材料科学研究材料微观组织和晶体结构；纳米技术研究纳米材料等。
光学显微镜：
广泛应用于学校教学、医学诊断等领域，如观察血液涂片、病理切片、微生物学基础研究等。
