蛋白质纯化是所有蛋白质研究的基础，蛋白质纯化系统能够快速分离纯化多种生物分子，不论是来源于人类还是动物、植物、微生物，能够纯化分离包括各种蛋白质例如天然蛋白质、重组和融合表达蛋白质、抗原抗体等以及多肽、寡核苷酸、质粒、病毒、小分子等。使用蛋白质纯化系统还可以进行生物大分子的规范化纯化，纯化实验设计，蛋白质的定性等。
该设备主要利用不同的层析技术和纯化填料，结合液体流动动力和液体成分检测功能，实现对目标蛋白质的准确分离和纯化。这些层析技术包括分子筛层析、亲和层析和离子交换层析等。
蛋白质纯化系统的工作流程：先是样品的制备和前处理，包括细胞破碎、去除细胞碎片和杂质等。然后是样品加载到纯化系统中，根据目标蛋白的特性选择合适的分离技术和柱子。接下来是洗脱步骤，通过改变洗脱缓冲液的组成和pH值等条件，去除非目标蛋白和杂质，保留目标蛋白。然后是收集纯化后的目标蛋白，进行检测和分析，以确定纯度和活性。
