PAE-PEG-CHEMS（聚(β-氨基酯)-聚乙二醇-半琥珀酸胆固醇）在基因治疗领域虽然具有广泛的应用前景，但也存在一些局限性。
免疫反应：
尽管PAE-PEG-CHEMS作为载体材料在一定程度上能够减少免疫系统的识别，但仍然存在引发免疫反应的风险。这可能导致治疗效果降低，甚至对患者造成进一步的伤害。
毒性问题：
长期或大量使用PAE-PEG-CHEMS作为基因递送载体，可能会在体内积累并产生毒性作用。这需要对载体的毒性进行严格的评估和控制。
递送效率受限：
尽管PAE-PEG-CHEMS具有增强基因递送效率的潜力，但在实际应用中，递送效率可能受到多种因素的影响，如细胞类型、疾病状态、载体浓度等。这可能导致治疗效果不稳定或难以达到预期。
基因稳定性问题：
在递送过程中，基因可能受到体内酶的作用而发生降解或失活。尽管PAE-PEG-CHEMS具有一定的保护基因免受降解的作用，但这种保护作用可能并不一定有效。
载体设计挑战：
设计合适的PAE-PEG-CHEMS载体需要充分考虑其化学结构、靶向性、稳定性以及生物相容性等多个方面。这增加了载体设计的复杂性和难度。
制备工艺要求高：
PAE-PEG-CHEMS载体的制备需要严格的工艺控制和质量控制。这包括载体的纯度、浓度、稳定性等方面的检测和控制。制备工艺的复杂性和高要求可能限制了其在实际应用中的推广。
疾病类型限制：
并非所有类型的疾病都适合采用PAE-PEG-CHEMS作为基因递送载体。例如，对于某些需要高效、快速递送的疾病，PAE-PEG-CHEMS可能无法满足要求。
