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蛋白质翻译后修饰的测定

上海鑫闵生物科技有限公司

2012/12/17 9:30:36

许多蛋白质在合成后可进一步修饰。通常是加上糖基、磷酸根或硫酸根。这些修饰有多种用途,包括作为特殊的胞内或胞外转运系统的标记蛋白、帮助特异蛋白质的折叠优化或作为调控元件改变靶底物的关键特性。利用修饰基团的特异性放射前体标记细胞,然后进行免疫沉淀即可分辨出翻译后修饰了的蛋白质。

    虽然有数百种不同的翻译后修饰,但许多修饰不能用特异的放射活性前体进行研究。因为从商业角度考虑,并不总是能得到正确的前体。前体亦不能被细胞摄取,或细胞内池不够大,不能得到具有高特异性的活性分辨基团等。然而,仍有很多修饰过程可用此法研究。
    通过免疫沉淀/免疫印迹检测酪氨酸磷酸化
    蛋白质在酪氨酸残基上的磷酸化能通过抗磷酸酪氨酸的抗体来检测。直接从未标记的细胞中通过免疫沉淀抗原可以检测其酪氨酸磷酸化,通过SDS-PAGE将免疫沉淀的蛋白质分离,使用常规的免疫印迹法转移到硝酸纤维素膜上。使用磷酸化酪氨酸的特异性抗体进行免疫印迹。
    糖基化
    在研究蛋白质的糖基化时,使用特异性抗体通过免疫沉淀相应的抗原是极为有用的方法。当蛋白质在SDS-PAGE中迁移时,首先要注意的就是糖基化。免疫沉淀下来的蛋白质如果被糖基化,则计算出的分子质量就比预计的大30%~50%,而且条带会变宽。糖基化对细胞有多种作用,但主要是作为蛋白质转运的特殊步骤中的标记蛋白,蛋白质的结构改变可导致其活性改变。或提供细胞外的结合区,从而对细胞内的信号传导及组织发育发挥作用。
    按照与多肽连接的不同可将糖基化分为两种形式。N端糖基化通常将一个糖基,几乎都是N—乙酰半乳糖胺,与天冬酰胺的氨基基团相连,O端糖基化可将多种糖与丝氨酸的羟基相连。蛋白质很少被单个糖基修饰。糖基化难以研究的原因在于糖链上有许多不同的糖基,多糖骨架中糖基的顺序也不同,而且侧链的延伸与分支存在多样性。
    研究蛋白质的糖基化有两种常用的方法:①以放射性单糖标记细胞,使其被摄取后加在糖骨架上;②以特异性的化学试剂或酶裂解成分处理纯化的多肽,去除部分或全部的糖基。特异性抗体有助于两种过程的实施。在标记的单糖发挥作用之后,将蛋白质沉淀并通过SDS-PAGE分离,然后检测其放射活性。掺有[32S]标记的蛋氨酸或其他氨基酸的蛋白质可进行免疫沉淀,然后以化学的或酶裂解成分处理或不加处理,通过SDS-PAGE分离后检测活性的改变。活细胞用[3H]半乳糖或[3H]甘露糖进行放射标记,标记时间应较短,不超过1h,因为多糖可很快参与多种不同的生物合成途径,含糖复合物以外的其他大分子中也可标记。断裂也是问题,因为没有简单的方法可破坏所有的糖基化或全部的N端糖基化或O端糖基化。多肽—N糖基酶F常被用来裂解N端糖基,它可以断裂大部分的N端糖基。其他常用的酶包括内源性糖苷酶H和内源性糖苷酶F。尽管从技术上讲化学裂解较为复杂,但许多研究者认为一旦在实验室建立该方法,便更可靠有效。zui常用的化学裂解物是无水氟甲噻嗪。如需获得上述问题更详细的资料,读者可参阅Vavki(1994)的放射标记法和细胞生物学新进展。
    烯化
    已知细胞中0.1%一0.5%的蛋白质可加上类异戊二烯进行修饰。用作蛋白质修饰的类异戊二烯有farnesyl和geranylgeranyl基团。这些疏水性成分常用来将蛋白质锚着在脂质膜上。常修饰的是羧基端的半胱氨酸残基,通过巯基酯相连。
    采用[3H]代谢标记类异戊二烯的前体物甲羟戊酸(mevalonate)可检测烯化,有4种不同的标记方法可供选择。早期实验采用在相对低水平的结合培养基中加入高水平[3H]—甲羟戊酸(>500uCi/m1)。阻断甲羟戊酸的内源性合成有助于其掺入。在细胞内HMGCoA在HMGCoA还原酶的作用下,生成甲羟戊酸。在代谢标记实验中,抑制HMGCoA还原酶,可减慢此合成反应,增加[3H]—甲羟戊酸掺入到farnesyl和geranylgeranyl基团的前体物中的量。HMGCoA还原酶的特异性药物(mevinnolin)使此步得以实施。第三种变化是增加甲羟戊酸的转运率,甲羟戊酸的转运体zui近已被克隆,并且可转入待检测的细胞中。此外,少数细胞系具有选择性高水平转运能力,  目的基因可转染这些细胞来研究烯化作用。
    硫酸化
    许多细胞外蛋白可通过加入硫酸后被修饰,zui有特点的是葡萄糖氨基酸多糖(glycosaminoglycans),如肝素硫蛋白多糖和粒素(granins)。将生长的细胞置于含有[35S]标记的硫酸,而不含未标记硫酸盐(MgCl2取代MgS04)的少量培养基中,可以检测硫酸化过程。如果需要加入血清,用透析和双重滤过除菌的样本去除培养基中的硫酸。放射性标记硫酸盐的终浓度应接近0.5uCi/m1。标记时间应该比肽链延长的时间稍短。对于仍处于分泌途径中的蛋白质,标记时间不应超过5min,对已分泌的蛋白质和胞外的基质蛋白,通常要孵育标记30~60min。
分泌蛋白可直接从培养基中通过免疫沉淀进行标记,胞内蛋白在洗涤细胞和用裂解缓冲液处理后可释放出来,然后采用常规的标记方法进行免疫沉淀。通过放射自显影或磷光成像仪检测SDS-PAGE上硫标记的蛋白质。

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